在知识经济时代，高新技术产业以其高附加值、低污染、市场潜力大等优点，成为世界上各个国家竞相发展的产业。一个国家高新技术产业的发展水平和发展规模甚至决定着该国当前以及未来在国际市场上的竞争力。我国的高新技术产业发展较晚，直至上个世纪80年代国家启动“863”计划和“火炬”计划后才有了较快发展。在地域分布上，我国的高新技术产业主要集中在长三角、珠三角和环渤海三个经济区。且不同的高新技术行业在这三个经济区中的分布各有侧重，在区域间的相对竞争力也各有不同。2010年，这三大经济圈高新技术产业总产值和出口交货值分别高达60608亿元和34053亿元，占全国高新技术产业总产值的81%，出口交货总值的92%。但与发达国家相比，我国的高新技术产业发展仍然相对滞后。当前对我国三大经济圈高新技术产业的研究十分有限，尤其是缺少用完整的指标体系来定量分析不同高新技术行业竞争力的研究。本文针对三大经济圈内高新技术产业的竞争力进行了深入细致的研究，在基本面分析的基础上建立了因子分析模型，选取了医药、航空航天、电子及通信设备、电子计算机和医疗设备五个制造类行业为代表，通过定性和定量两方面的分析对五个行业各自在三个经济圈之间的竞争力优势进行了比较研究。长三角的高新技术产业拥有产出效率方面的优势，珠三角则具有投入和创新力方面的优势，环渤海区具有政策和技术支持优势。电子及通信设备、电子计算机主要集中在长三角和珠三角，航空航天主要集中在环渤海地区，医疗设备主要集中在长三角，医药制造业则主要集中在环渤海地区和长三角。医药制造行业中，长江三角洲和环渤海经济圈的竞争力是最强的。长三角的竞争优势来源于生产效率和研发能力两方面，而渤海经济区的优势只来源于生产效率。航空航天器制造业中，环渤海经济圈的竞争力最强；渤海经济区的竞争优势主要来源于生产效率。电子及通信设备制造业和电子计算机及办公设备制造业这两个行业都是珠三角经济圈的竞争力最强，且远远强过其他两个经济圈，这两个行业在在珠三角的竞争优势同样都主要来自于生产效率。医疗设备及仪器仪表制造业中，长江三角洲的竞争力是最强的。该行业在长三角的竞争优势来源于生产效率、产业规模和研发投入。本文对五个高新技术行业在三大经济圈之间相对竞争优势的研究，对于分析不同产业的发展趋势和制定区域产业发展战略都具有参考作用。区域产业发展应当着重于具有竞争优势的行业，做强做大使其具有更强的竞争力。