生物信息学数据库研究:基于多平台、面向对象的数据格式转换软件的设计和开发

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该文试图通过编写一种软件来实现格式之间的相互转换.文中首先介绍了生物信息学研究中生物信息数据库和生物学软件的重要性,提出了该课题需要完成的主要目标:格式转换、可扩展、多平台、通用格式.其次深入研究了一些最常用数据库格式如EMBL、GenBank、GCG、ACEDB.对这些格式的掌握是完成格式转换软件的必要条件.接着介绍了面向对象编程技术、JAVA语言和XML技术.这是实现软件编程的必要技术,并将XML作为一种通用格式引入.最后文章详细说明了转换程序的设计思想和程序中主要类和接口的定义,同时对程序的使用做了一个比较详细的说明.该软件可以在多种操作系统下运行,目前支持的格式不多,但是由于采用了面向对象的技术,每一种格式都被定义为一个类,新增格式只要实现一个派生类即可,具有很好的扩展性和代码重用性.
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