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通过测定光唇鱼和宽鳍鱲的线粒体全序列，我们发现它们都是由单个共价闭合的环状染色体组成，序列长度分别为16589bp和16611bp。其基因排列顺序与已发表的鲤科鱼类线粒体全序列类似。都包含13个蛋白质编码基因，22个tRNA基因，2个rRNA基因，和1个D-loop区。两种鱼的蛋白质编码基因除COX1是以GTG作为起始密码子外，其它均是以ATG起始密码子，但它们终止密码子的使用却有所不同，包括了TAA，TAG，TA和T。光唇鱼和宽鳍鱲线粒体全序列中A+T含量分别为55.7%和56.2%，表现出A+T的偏好性，这与脊椎动物偏好A+T是一致的。通过与其他鲤科鱼类的控制区比较，我们识别了这两种鱼的控制区的3个保守序列区域。