生态创新是协调经济发展和环境保护的优先方法,不仅可以大幅提高资源利用率带来环境效益,还可以培育新的市场机会创造经济效益。农业企业提供的产品和服务直接或间接来源于生态系统,关系着消费者的身体健康与营养状况,是实施生态创新的良好载体。但现有关于企业生态创新行为的研究多针对重污染的工业企业,不仅缺乏结合中国企业实际的相关研究,关于农业企业生态创新的研究几乎没有。基于此,本研究采用探索性案例分析方法旨在探索生态创新在农业企业中的运作机制,以及农业企业生态创新行为及其绩效之间的关系。在对扎根理论、创新理论、行为理论、利益相关者理论和资源基础观等理论进行系统分析的基础上,本研究采用深度访谈收集10家具有明显生态创新特征的典型农业企业约7万字的访谈资料,并运用扎根理论对访谈资料进行开放编码、主轴编码及聚类分析,共得到131个概念和24个类属,按照“因果条件—现象—情景—中介条件—行动—结果”的模式,构建出包含6个层次19个二级子构件的农业企业生态创新结构模型,该结构模型不仅可以描述农业企业生态创新的整体运作过程,还可对农业企业生态创新的运行绩效进行评估。文章较为深入地探究了不同动机下生态创新行为对其绩效的影响,研究将农业企业生态创新动机分为政策驱动、利润驱动和企业社会责任驱动,分析了不同动机下农业企业生态创新的行为表现,并以实例形式分析了不同动机下生态创新行为与企业绩效之间的关系,发现由追求利润而自发驱动的生态创新行为带来的财务绩效和生态绩效最大,由企业社会责任驱动的生态创新行为往往会给该企业带来较高的社会地位和良好的企业形象,在短期内由刺激性政策驱动的生态创新往往比准入型政策驱动的生态创新有更好的运行效果,并针对以上研究发现为政府和农业企业推进相关生态创新实践提供了切实可行的建议,即农业企业应注重自发地进行生态创新行为以获得最佳的财务绩效、生态绩效和企业社会地位,而政府在制定政策时也应注意多制定扶持刺激性政策而不是强制性的环境规制,这样有助于在更大范围内形成生态创新的良性循环。