目的：基于中医传承辅助系统(V2.0)软件,总结余绍源教授治疗慢性萎缩性胃炎的经验及用药规律,有利于名老中医经验的传承,并为中医治疗慢性萎缩性胃炎的临床和科研工作提供思路及参考。方法：本课题包括文献研究、数据挖掘研究两大部分。文献研究主要从中西医两个方面对慢性萎缩性胃炎的病因、致病机理、治疗等进行文献整理及探讨。数据挖掘研究基于中医传承辅助系统对余绍源教授治疗慢性萎缩性胃炎的方剂的数据挖掘。通过收集2010年至2013年广东省中医院名老中医门诊余绍源教授接诊的83个慢性萎缩性胃炎患者172份门诊病历处方,利用中医传承辅助系统进行数据挖掘,采用该软件集成的频次统计法、改进互信息法、复杂系统熵聚类及无监督的熵层次聚类等数据挖掘方法,分析研究余绍源教授治疗慢性萎缩性胃炎的处方用药经验。结果：通过对余绍源教授2010年至2013年治疗慢性萎缩性胃炎83个患者的172个门诊处方进行分析,共收录药物125味,常用药物有陈皮、木香、白术、砂仁、党参、麦芽、稻芽、黄芪、白花蛇舌草、半枝莲、紫苏梗、茯苓、厚朴、海螵蛸、浙贝母、蒲公英、枳壳、竹茹、鸡内金、佛手、枳实、六神曲、布渣叶、郁金等,以清热、补虚、解表、理气、化痰药为主。基于关联规则的药物组合及药物关联情况分析,支持度为70时,软件共分析出9条数据,包含中药6味；下调支持度个数为60,软件共分析出18条数据,包含中药9味；下调支持度个数为50,软件共列出62条数据,包含中药10味。基于无监督的熵层次聚类的新处方分析,演化出3-4味药的核心组合,共计12个,包括竹茹、蒲公英、陈皮,菊花、薄荷、辛夷,当归、升麻、木香,枳实、槟榔、半枝莲,布渣叶、党参、莱菔子、白术,竹茹、砂仁、麦芽、陈皮,蒲公英、佛手、陈皮,菊花、薄荷、细辛,当归、木香、柴胡,枳实、槟榔、白花蛇舌草,布渣叶、厚朴、莱菔子、白术,竹茹、砂仁、稻芽、陈皮；并形成治疗慢性萎缩性胃炎新处方共6个。结论：1.余绍源教授认为慢性萎缩性胃炎主要由虚、瘀、毒三者相互作用引起,治疗慢性萎缩性胃炎多用益气行气、清热解毒类药物。2.中医传承辅助系统(V2.0)软件集成的频次统计法、改进互信息法、复杂系统熵聚类及无监督的熵层次聚类是一类新的数据挖掘方法,对挖掘余绍源教授治疗慢性萎缩性胃炎的处方规律具有一定科学性。利用该软件可以实现患者就诊情况的录入管理、分析,便于医生建立和管理患者的长期档案,辅助总结名老中医经验及传承,有利于中药新处方的研究发现。3.运用该软件生成的药物核心组合及中药新方仅停留于理论层面,实际应用仍需配合临床医生的判断、临床试验研究等进一步论证合理性。