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长河水系是北京城市河湖水系的重要组成部分,其中西海、后海、前海、北海与中南海被喻为“城市的心脏”。2003—2004年的调研结果显示,长河水系初级生产力主要决定于浮游藻类的群落组成和细胞密度。定性、定量样品中共观察到的浮游藻类有8门,87属,204种。群落结构为蓝藻—绿藻型,细胞密度为41150×104/L,是1987年的62.88倍。优势种群为微囊藻（Microcysis）、颤藻（Oscillatora）、栅裂藻（Scenedesmus）、小球藻（Chlorella）、小环藻（Cyclotella）、直链藻（Melosira）,均为富营养型或重富营养型水体指示种群。长河水系已连续三年在夏秋季出现程度不同的、以微囊藻占绝对优势的蓝藻水华,水质较差,水生态系统失衡。 长河水系营养盐含量高（TN:1.667mg/L,TP:0.144mg/L）,水体透明度低（0.52m）,TN、TP、CODMn、BOD5、SD五项指标的TSIM值均处在54—88之间,表明北京长河水系水体均已达到富营养化或重富营养化程度。按中华人民共和国地表水环境质量标准（GB3838-2002）中南海入口、中海、南海、筒子河出口为Ⅳ类水,符合人体非直接接触地娱乐用水标准;麦钟桥、后海、前海、北海入口为Ⅴ类水体,仅符合一般景观水域要求;高粱桥、西海、松林闸为劣Ⅴ类水体,还达不到一般景观用水的标准。 两年的调研与实验结果显示,造成北京城市河湖水体发生富营养化和蓝藻水华的主要原因是（1）以氮磷为主的植物营养物的污染比较严重;（2）由于北京水资源紧缺,补给城市河湖的生态用水量很少,仅够维持渗漏与蒸发;（3）河湖底部硬化、护坡衬砌的“三面光”结构破坏了水系生态系统,严重降低了水体自净能力。本文对如何改善北京城市河湖水质,防治蓝藻水华提出了六条建议。