载体法筛选人巨细胞病毒UL54基因小干扰RNA靶位体系的建立

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sgzhou22
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
人巨细胞病毒是免疫功能低下宿主的重要病原体,也是宫内感染引起先天性畸形以及儿童多器官损伤的一个重要致病因子。当前的抗病毒药物不能完全清除人巨细胞病毒,长期、反复用药引发的药物毒副作用及不能忽视的耐药问题促使人们寻求一种更安全更有效的治疗方法。RNA干扰作为一种新型的基因阻断技术,因其高效性、强特异性、低毒性等优点,在抑制病毒的复制、表达等方面显示出了其强大的应用潜力。UL54基因编码HCMV的DNA多聚酶,为病毒复制所必需,它可作为HCMV感染基因治疗的靶基因。siRNA在RNAi过程中起着关键作用,因其识别的mRNA靶序列可能存在复杂的二级结构干扰siRNA的识别。因此,合理设计siRNA并筛选出理想的靶位是十分有必要的。在本研究中,我们利用pAVU6+27质粒,设计并构建6个shRNA表达载体(psiUL54-1~6),与融合蛋白表达载体pUL54S1/2-EGFP共转染AD293细胞,荧光显微镜下观察融合蛋白的荧光表达情况,通过RT-PCR来分析UL54S1、UL54S2 mRNA水平的变化并利用流式细胞仪评价siRNA对融合蛋白的抑制作用,最终建立人巨细胞病毒UL54基因小干扰RNA靶位筛选体系。本研究分二部分:第一部分,融合蛋白表达质粒pUL54S1-EGFP、pUL54S2-EGFP的构建及在AD293细胞中的表达;第二部分,人巨细胞病毒UL54基因小干扰RNA靶位筛选体系的建立。第一部分融合蛋白表达载体pUL54S1-EGFP、pUL54S2-EGFP的构建及在AD293细胞中的表达方法:扩增人巨细胞病毒UL54基因967-1750及2308-3070位点的序列,分别命名为UL54S1(784bp)及UL54S2(763bp)。UL54S1、UL54S2用HindⅢ和EcoRⅠ双酶切后分别定向克隆入已行双酶切的质粒pEGFP-N1中,连接产物转化感受态细胞DH5α中,PCR法及双酶切法筛选阳性克隆,并进行测序验证。构建成功的融合蛋白表达质粒行脂质体法转染AD293细胞,转染后24h、48h通过荧光显微镜观察荧光蛋白的表达情况,运用流式细胞仪检测AD293细胞表达EGFP阳性细胞率和平均荧光强度。结果:1.PCR法及HindⅢ、EcoRⅠ双酶切法筛选阳性克隆并进行测序,结果与GenBank登录的HCMV AD169株的UL54基因(gi:1487749)967-1750及2308-3070位点的DNA序列完全一致。2.质粒pEGFP-N1及融合蛋白表达质粒pUL54S1-EGFP、pUL54S2-EGFP转染AD293细胞24h、48h后均可在荧光显微镜下观察到增强型绿色荧光蛋白的表达,而空白对照组则无增强型绿色荧光蛋白的表达。3.流式细胞仪检测结果显示48h pEGFP-N1组平均转染率为38%,平均荧光强度为590;pUL54S1-EGFP组平均转染率为47%,平均荧光强度为547;pUL54S2-EGFP组平均转染率为56%,平均荧光强度为578。结论:成功构建融合蛋白表达质粒pUL54S1-EGFP、pUL54S2-EGFP,运用荧光显微镜可检测到增强型绿色荧光蛋白在AD293细胞中的表达。利用流式细胞仪可测定每孔细胞表达EGFP的阳性细胞率及平均荧光强度,达到对UL54S1、UL54S2基因的定量分析,为后续成功筛选出有效的siRNA靶位提供了依据。第二部分人巨细胞病毒UL54基因小干扰RNA靶位筛选体系的建立方法:利用siRNA在线设计工具选取6个siRNA靶位点,合成相应的shDNA模板。利用合成的shDNA模板及pAVU6+27质粒,构建6个shRNA表达载体,命名为psiUL54-1~6。shRNA表达载体与融合蛋白表达载体pUL54S1/2-EGFP共转染AD293细胞,荧光显微镜下观察融合蛋白的荧光表达情况,通过RT-PCR分析UL54S1、UL54S2 mRNA水平的变化,并利用流式细胞仪评价siRNA对融合蛋白的抑制作用。结果:1.PCR法筛选shRNA表达载体阳性克隆,经测序,psiUL54-2~6序列与预期序列完全一致。2.荧光显微镜下观察质粒psiUL54-4~6与pUL54S2-EGFP共转染AD293细胞48h后细胞中荧光蛋白的表达无明显变化;质粒psiUL54-2与pUL54S1-EGFP共转染AD293细胞48h后荧光蛋白的表达无明显变化;质粒psiUL54-3与pUL54S1-EGFP共转染AD293细胞48h后可引起荧光蛋白的表达下降;3.RT-PCR结果显示质粒psiUL54-4~6与pUL54S2-EGFP共转染AD293细胞24h、48h后UL54S2 mRNA水平无明显变化;质粒psiUL54-2与pUL54S1-EGFP共转染AD293细胞24h、48h后UL54S1 mRNA水平无明显变化;质粒psiUL54-3与pUL54S1-EGFP共转染AD293细胞24h后UL54S1 mRNA水平无明显变化,转染48h后则可引起UL54S1 mRNA水平的下降。4.流式细胞仪检测结果进行统计分析发现质粒psiUL54-2与pUL54S1-EGFP共转染AD293细胞48h对融合蛋白UL54S1-EGFP的表达无影响(P>0.05);质粒psiUL54-3与pUL54S1-EGFP共转染AD293细胞48h对融合蛋白UL54S1-EGFP的表达有抑制作用(P<0.01);质粒psiUL54-4~6与pUL54S2-EGFP共转染AD293细胞48h后对融合蛋白UL54S2-EGFP的表达均无影响(P>0.05)。结论:质粒psiUL54-3表达的siRNA能下调UL54S1基因mRNA水平,有效抑制融合蛋白UL54S1-EGFP的表达;UL54基因序列中1532-1550位点是有效的siRNA靶位点;成功建立载体法筛选人巨细胞病毒UL54基因小干扰RNA靶位的体系。
其他文献
目的:  1.研究术后疲劳综合征(Postoperative Fatigue Syndrome,POFS)大鼠模型AMPK信号通路影响蛋白质代谢相关分子变化规律。  2.观察在应用人参皂苷Rb1(Ginsenoside Rb1)
【目的】 CDK9(Cyclin-Dependent Kinase9,细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶9)是正性转录延长因子b(Positive Transcription Elongation Factor b,P-TEFb)的催化亚基,通过磷酸化RN
数学是一门比较抽象的学科,而小学阶段的学生由于年龄的原因,学习数学更是有一定的难度。此外,数学是一门考察学生逻辑思维、空间想象等能力的学科。新课改要求教师在引导学生学
异位妊娠是妇产科常见的急腹症,发病率约为2%,输卵管妊娠占95%以上,是导致孕产妇死亡原因之一.近年来,随着快速高敏人绒毛膜促性腺激素、高分辨率阴道超声等技术的发展,早期
为提高公路工程质量管理,使其适应不断发展的公路工程建设需求,我们要加强对公路工程项目的管理和控制,把握公路工程质量管理的关键环节,分析探讨如何强化公路工程质量,确保证建设
怀柔区作为北京市的远郊区县,村庄分布相对分散,大规模集中党员进行经常性培训有一定难度。近几年来,我们积极加快远程教育基础设施建设,不断创新教育模式,完善管理机制,充分
有人说他是一头黄牛,在家乡的土地上辛勤耕耘着,为乡亲们造福;有人说他是一棵白杨,扎根在家乡的土地上,为乡亲们遮风挡雨。他自己说:“作为一名农村基层干部,带领乡亲们致富
利用35MeV的质子束轰击ThO2粉末靶,通过(232)Th(p,3n)反应产生(230)Pa核,经用放射化学方法分离出(230)Pa核并制成(230)Pa→(230)U测量源.用聚乙烯对苯二酸酯固体核径迹探测器记录其发射的重离子径迹.经248天的收集,观测到了两
我校药剂学专业在特色专业建设过程中基于人才培养模式进行探索,并基于探索经验进行成果的总结.本专业教学质量工程建设,核心建设目标就是人才培养模式的改革与突破,以及学生
6月25日是第30个全国土地日,今年的宣传主题是“节约集约用地,严守耕地红线”.主题宣传活动启动以来,河南省自然资源系统紧紧围绕宣传主题,精心策划、周密部署,组织开展了形
期刊