板栗花芽分化相关基因克隆与RNA干扰载体构建

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板栗(Castanea mollissima)是世界上分布广泛、经济栽培价值高的一种园艺作物。板栗为山毛榉科栗属植物,属于落叶乔木,源自中国,是一种比较古老的果树。板栗为葇荑花序、雌雄同株的植物。由于板栗雌雄花器官发育不同步,且雄花数量远高于雌花,过多的雄花消耗了大量营养,直接导致板栗产量减少。对其生长及开花过程的研究,已经从形态学上掌握了雌雄花芽发育的规律,但是对影响板栗开花的相关基因调控机理的分子水平研究还有待深化。FLC作为调控有花植物开花时间的关键基因,在春化作用途径中抑制下游开花基因的表达,从而在植物开花控制方面起决定作用。本实验以罗田板栗主栽品种玫瑰红为研究材料,通过反转录及RACE技术对板栗花芽分化相关基因FLC和MADS的cDNA进行克隆,获得这两个基因的cDNA全长序列,基于其序列的生物信息学分析结果,构建了FLC RNA干扰的植物表达载体,为后续研究该基因的表达分析奠定基础。本文研究的内容及结果主要有以下两方面:(1)板栗FLC基因的cDNA全长序列分离及分析。在设计特异性引物的基础上,利用RACE技术,从板栗叶片总RNA中分离了CmFLC cDNA的全长序列,该序列全长为968bp,其中有一个编码含227个氨基酸蛋白序列的开放阅读框。通过生物信息学预测,CmFLC蛋白的理论等电点为5.80,分子质量为25.62kDa,N端含有M盒保守序列,该蛋白的二级结构大部分由无规则卷曲和α-螺旋构成。蛋白质的同源分析结果显示,CmFLC存在两个特征性序列区域,分别是M盒、K盒。建立模型进行同源分析,结果显示CmFLC蛋白与毛白杨FLC蛋白的三维结构存在高度相似性。通过系统进化分析,证实板栗的FLC蛋白属于植物进化分支,并且与山核桃的FLC蛋白同属一支。(2)板栗MADS基因的cDNA全长序列分离、分析及CmFLC基因RNA干扰载体构建。通过RNA反转录及RACE技术从板栗叶片和花的总RNA中分离到全长为922bp的CmMADS的cDNA序列,该序列有一个编码含227个氨基酸蛋白序列的长度为681bp的开放阅读框。通过生物信息学预测,CmMADS蛋白的理论等电点为6.27,分子质量为25.87kDa,其N端含有M盒保守序列,其二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成。将蛋白质进行同源分析显示,CmMADS存在两个特征性序列区域,分别为M盒、K盒。蛋白质同源建模分析结果表明CmMADS蛋白序列同苹果MADS蛋白的三维结构具有较高的相似度。系统进化分析结果显示,板栗的MADS蛋白属于植物进化分支,并且与太行花的MADS蛋白同属一支。将CmFLC基因两段长度同为283bp的反向互补片段Fflc和Rflc连入载体pBluescript SK plus,构成中间载体pBluescript SK plus-FR。用Kpn I和BanH I同时酶切植物表达载体pcl301-ubi及中间载体pBluescript SK plus-FR,回收pBluescript SK plus-FR的酶切片段,连入到pcl301-ubi片段中,植物表达载体pcl301-ubi-CmFLC-dsRNAi得以构成。下一步拟用构建好的RNA干扰载体转化农杆菌,并由转化后的农杆菌介导,将重组质粒转入板栗组织中,为深入研究该干扰载体的功能以及CmFLC基因的功能奠定基础。
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