SETD8在基因组稳定性的维持和肿瘤发生中的作用 ——来自一对双胞胎的启示

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:baimeimei
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:肿瘤是多基因参与、逐渐演变的一种疾病,受遗传因素和环境因素的共同调控,基因组不稳定是肿瘤细胞最重要也是最本质的特征。自身基因缺陷或在外界有害因素作用下,会导致基因组不稳定的产生,进而增加了获得性突变的频率。目前已知许多基因的突变与肿瘤密切相关,这些突变在肿瘤的评估和治疗中发挥重要作用。为了更加深入、全面了解各种类型肿瘤的发生发展,对未知的肿瘤相关基因突变的挖掘至关重要。全基因组外显子测序(Exomesuquencing)技术是对人类基因组的外显子进行测序,主要用来发掘罕见变异和孟德尔遗传疾病的致病基因,在发现新的肿瘤相关基因方面得到了广泛应用。我科收入院一位10岁女童,病理确诊为肺右主支气管炎性纤维母细胞瘤。追溯家族史,发现患者的同卵双生双胞胎姐妹身体健康。因同卵双生双胞胎生长环境基本相同,基因相似度高度一致,二人极少量的基因差异可能参与了患者肿瘤的发生。目的:通过全基因组外显子测序发掘可能与患者肿瘤发生相关的基因突变,并研究其机制。方法:(1)为了筛选出患者携带的可能与肿瘤相关的基因,我们取上述双胞胎外周血提取基因组DNA,IlluminaHiseq测序,分析基因组SNPs(Single nucleotide polymorphism)、InDels(Insert and delation)、CNVs(Copy number variations)、SVs(Structuralvariation)等突变,过滤千人基因库(北京诺禾致源生物信息科技有限公司),保留突变频率低于1/100的突变位点,进一步保留外显子编码区或剪接位点区的变异,去除同义突变后保留对基因表达产物有影响的突变,应用SIFT、Polyphen、MutationTaster、CADD四个软件进一步分析,保留可能有害的突变位点,再以双胞胎中健康者为对照,筛选出患者特有的突变。(2)为了从生物学水平验证筛选出的突变是否是罕见的肿瘤相关基因变异,我们挑选出人群突变率低于1/10^5的基因,分别是FRG1,SETD8,BEGAIN,KIR2DL3,分别设计特异性siRNA,检测在U20S(人骨肉瘤细胞)和HBE(人支气管气道上皮细胞)中敲除各基因后细胞的增殖和凋亡情况,借此锁定可能与肿瘤相关的基因setd8。(3)为了验证SETD8的功能,我们设计了 2条特异性siRNA,在U20S和HBE细胞中敲除SETD8,细胞计数和克隆形成实验检测细胞增殖,β-Gal(细胞衰老半乳糖苷酶染色)检测细胞衰老,流式细胞术检测细胞周期和凋亡,免疫荧光检测细胞的DNA损伤修复反应标志物RPA和.γ-H2AX,DNA fiber检测DNA复制速度和复制叉;将setd8cDNA连接至真核生物载体,在U20S和HBE细胞中过表达SETD8,流式细胞术检测细胞周期,免疫荧光检测DNA损伤修复反应标志物RPA和γ-H2AX。(4)为了验证患者setd8基因上携带的单核苷酸突变对蛋白功能的影响,我们在 U20S 和 HBE 细胞中过表达 wildtype 和 mutant GFP-SETD8,GFP-Trap 拉下GFP-SETD8融合蛋白及和SETD8有相互作用的蛋白,质谱分析和western blot检测H4和H4K20mel的蛋白水平。结果:(1)siRNA分别特异性敲除细胞中的FRG1,SETD8,BEGAIN和KIR2DL3,只有SETD8的缺失引起细胞增殖减慢,凋亡增加,表明SETD8的变异最可能和肿瘤相关;(2)用2条不同的siRINA沉默细胞的SETD8后均出现了细胞增殖的受抑,衰老和凋亡的增加,说明SETD8对细胞活力的维持十分重要;(3)与对照组相比,缺失SETD8的细胞中RPA和γ-H2AX明显增高,说明SETD8的沉默诱导了自发性DNA损伤修复反应;(4)siRNA敲除SETD8后,DNA的复制速度减慢,说明SETD8的缺失对细胞产生了复制压力,发生DNA损伤修复,DNA复制受阻,但是在统计复制叉比率时未发现停滞的复制叉数量增多;(5)WEE1抑制剂干预SETD8缺失的细胞,细胞的增殖受限相较于单纯干预WEE1抑制剂组更加明显,WEE1的抑制和SETD8缺失的叠加也会导致更多的细胞凋亡和DNA损伤修复反应,表明SETD8缺失的细胞对WEE1抑制剂的作用更加敏感;(6)通过外源性过表达wildtype和mutant SETD8,分析和其相互作用的蛋白,表明基因setd8的单核苷酸位点错义突变增强了蛋白SETD8与H4的结合及H4K20mel水平。结论:(1)SETD8通过影响DNA复制和损伤修复反应参与基因组稳定性的维持;(2)Setd8第904位核苷酸的突变增强了蛋白SETD8与H4的结合及H4K20mel水平。(3)下调SETD8可与WEE1抑制剂协同发挥抗肿瘤作用。
其他文献
目的探讨鼻腔冲洗治疗鼻后滴漏综合征(PNDS)的临床效果。方法 120例鼻后滴漏综合征患儿,随机分为对照组和研究组,每组60例。对照组患儿应用单纯药物治疗,研究组患儿在对照组基础上应用鼻腔冲洗治疗。对比两组患儿治疗效果,复发、不良反应发生情况,症状改善时间。结果治疗后,研究组患儿的总有效率96.7%明显高于对照组的78.3%,差异具有统计学意义(P<0.05)。治疗3个月后,研究组患儿的复发率8.
根据《普通高等学校图书馆规程》对于高校图书馆应在人才培养、社会服务与文化传承创新中发挥作用的要求,高校图书馆建立新技术体验区,不仅提升图书馆的信息化、社会化服务能力,还构建了一个学习探索和开拓思维的创新服务空间,同时也满足读者对新科技的体验和多元化需求,完善创新人才培养的支撑工作。本文通过介绍天津大学图书馆新技术体验区的发展理念与功能定位,并对近三年来天津大学图书馆新技术体验区的实践服务进行分析,
新生儿肺炎在临床是较常见的感染性的疾病,因肺炎感染导致呼吸道里分泌物增多且无法完全排除,从而使患儿出现缺氧或呼吸道梗阻等症状,发现早期如不进行合理适当的护理救治,会产生败血症、心衰等并发症,严重恶化后会提高患儿的病死率[1-2]。品管圈活动(QCC)是在共同的场所工作的人,为了提升工作效率并对出现的问题采取好的解决方法,自发形成小团体,该团体以尊重人格为起点,实施轻松且欢愉的管理方法,让员工
胰腺癌是恶性程度较高的消化道肿瘤之一,由于早期病情隐匿、疾病进展极快、化疗有效率低等原因,胰腺癌患者预后极差,5年总生存率仅约9%。近年来,随着居民饮食结构和生活方式的改变以及临床检出率的提高,胰腺癌发病率逐年升高,严重威胁居民的生命健康。大量基础研究的进展为胰腺癌的治疗提供了更多潜在靶点,高质量临床研究的成果也让更多理论上的创新和突破落到实处,这些都为胰腺癌患者预后的改善带来了新的希望。对202
为满足微裂隙岩体注浆加固要求,需研究一种强度高、黏度低的高性能注浆材料。选用超细水泥、硅粉、超细粉煤灰、聚羧酸系减水剂为原料,结合单因素试验和正交试验,对浆液进行改性。试验结果表明:在水泥中掺加4%~12%的硅粉,浆液的结石体强度可以提高8%~34%;用超细粉煤灰替代一定量的水泥,可以降低浆液的黏度,当粉煤灰替代量超过20%后,浆液黏度不再降低,达到作用极限值;聚羧酸系减水剂对于降低水泥浆液的黏度
从古希腊时代,自由贸易区雏形开始显现;到20世纪60年代后,在全球化浪潮的推动下,贸易与资本国际化合作不断深化,全球自贸区呈现出了多样化和综合化的发展态势,多种类型的自贸区共同发展。目前,世界上多数自贸区都显示出了多样化的综合性功能,包括了进出口及转口贸易、仓储和加工等等,这就在很大程度上提高了自贸区自身的发展效率和抵抗外部环境风险的能力。因此,各个国家都把自由贸易区的建设和发展作为重中之重,因为
中国-东盟关系已进入全方位发展的新阶段。"一带一路"作为经济带和文化带,为中国-东盟跨境体育赛事文化的交流与合作起到了促进联结作用。采用文献研究法、专家访谈法和实地调查法,对"一带一路"文化交流背景下中国-东盟跨境体育赛事交流发展现状、中国-东盟民族文化特征、中国特色体育精神文化意蕴表达,以及中国-东盟跨境体育赛事文化推进策略进行探讨,针对"一带一路"文化交流背景下中国-东盟跨境体育赛事促进的内外
为降低西瓜基质育苗生产成本,采用不同比例的辣椒秸秆与蛭石、珍珠岩进行复配,探讨其对西瓜幼苗形态建成及生理特性的影响,以明确最佳的草炭替代材料。试验设置L1(V辣椒秸秆∶V蛭石∶V珍珠岩=1∶1∶1)、L2(V辣椒秸秆∶V蛭石∶V珍珠岩=2∶1∶1)、L3(V辣椒秸秆∶V蛭石∶V珍珠岩=4∶1∶1)3个处理和对照CK(V草炭∶V蛭石∶V珍珠岩=2∶1∶1)。结果表明,L2处理的西瓜幼苗株高、茎粗、叶
期刊
亚洲溜冰演出制作公司(美国、中国香港)(Solidwater Productions Ltd.)于4月19、20、21日在郑州冰纷万象滑冰场举办《冰和戏武》,包括溜冰、豫剧、武术、现代舞表演。策划、导演刘中达;溜冰舞者大多是奥运的健儿:中国(陈梅)、中国香港(卢敬桑、Nathan Chen.)、中国台湾(江玫玫)、韩国(安杰拉·金)、英国(席妮德·克尔、约翰·克尔)、美国(内森·陈、亚当·瑞
会议