作为长江上游国家珍稀鱼类自然保护区的核心区，赤水河流域在保护长江上游特有鱼类多样性方面功不可没。然而，有关赤水河鱼类的重要饵料生物-大型无脊椎动物（以下简称无脊椎动物）的研究较少。本研究结合现场调查(2016年)和历史数据(2007年)，系统开展无脊椎动物群落多样性（物种、功能及系统发育）研究。在刻画多样性格局的基础上，探索驱动群落聚合和维持的过程和机制。同时，尝试开展基于无脊椎动物的赤水河健康状况评估工作。以期为赤水河流域的资源利用、保护和管理提供科学依据。主要结果如下:　　1、十年间，流域内土地利用格局发生明显变化。在检测的6类土地利用类型中，林地、灌草、水域面积、建筑物面积和其它类型均有所增加，比例分别为4％、4％、0.1％、0.5％和0.14％，而耕地则减少了8％。各河段（上中下游）的林地分别增加了7％、5％、3％，而耕地在上游和下游减少了10％和6％，在中游未发生较大变化。建筑物面积在上游和下游分别减少了0.4％，0.6％，而在中游增加了0.1％。河流的部分环境因子发生显著改变。　　2、记录了5门9纲88科303个分类单元，含水生昆虫242种，寡毛类32种，软体动物17种，甲壳类7种和其他动物5种。物种数、Shannon-Wiener指数、Margalef指数以及Simpson指数从上游到下游逐渐降低，且春季多样性高于秋季。　　3、群落结构和物种组成在不同季节和不同河段间均差异显著。局域（底质类型、海拔、总氮和电导率）和区域（土地利用）环境参数以及中宽尺度空间因子的共同驱动群落变化。三者共解释了群落变化的51.1％，包括局域(12.4％)，区域(11.9％)、空间因子(10.6％)和他们的共同作用(16.2％)。总群落、主动和被动扩散者群落的相似性（β多样性）亦显示其随环境梯度和空间距离的增加而显著减弱，表明环境过滤和空间过程（扩散限制）共同影响群落间物种组成的差异。环境过滤是影响三个群落分布的主要驱动过程，而空间过程对被动扩散者的影响相对明显。　　4、在检测的13类群落功能性状中，10类（化性、发育与生长、脱离水体能力、漂移状态、最大爬行速度、游泳能力、腮呼吸者、攀爬者、粘附者和牧食收集者）在空间上（上中下游）差异显著。鳃呼吸、柔软体形、非流线型体形为全流域的优势功能性状。6类性状（化性、繁殖力、脱离生境能力、游泳能力、身体形状、呼吸方式）只受环境因子影响，2类（爬行能力和个体大小）受空间因子影响。环境因素（海拔、底质类型、河宽以及水域面积）制约群落功能性状结构和组成，共解释了群落变异的39.02％。功能性状丰富度随物种数增加呈饱和增加（功能冗余），表明群落对干扰具有一定的抵抗力和恢复力。　　5、十年间，分类学多样性显著上升，主要由林地和耕地的变化驱动;功能和系统发育多样性则保持稳定。影响三种多样性格局的关键驱动力和过程不同，但基本保持稳定，表明驱动无脊椎动物群落的固有机制未发生显著改变。　　6、构建基于无脊椎动物群落组成的不同季节（春季和秋季）和不同河段（上中下游）的健康评价体系(无脊椎动物完整性指数，M-IBI)，对赤水河的健康状况进行评估。上游河段在春秋季分别包括6个和2个核心参数，中游的5个和4个，下游的3个和2个。健康状态分为4个等级:健康、亚健康、一般和不健康。在调查的17个河流断面中，春季的12个亚健康，5个一般;秋季的2个健康，8个亚健康，6个一般，1个不健康。从整体上看，赤水河处于亚健康状态。