染色体6p21.3区域与脉络膜新生血管及息肉状脉络膜血管病变的相关性分析

来源 :西南交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wilson_rui
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研究背景:老年黄斑变性(age-related macular degeneration,AMD)是老龄化群体中最主要的致盲因素之一,其可以分为萎缩型老年黄斑变性和渗出型老年黄斑变性(wet AMD,wAMD)。wAMD又可以进一步分成典型的脉络膜新生血管(choroidal neovascularization,CNV)和息肉状脉络膜血管病变(polypoidal choroidal vasculopathy,PCV)。CNV和PCV在临床表型上具有较高的相似性,使得有时很难区分这两种疾病。因此,使用遗传学方法找出可用于区分这两种疾病的分子标记能为临床诊断提供指导性的意义。研究目的:对比染色体6p21.3区域内五个基因上的六个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点 rs541862(CFB),rs429608(SKIV2L),rs12153855(TNXB),rs9391734(FKBPL),rs2071277(NOTCH4)rs3132946(NOTCH4)与中国汉族人群CNV及PCV的相关性,探索CNV与PCV遗传机制的差异。研究方法:本实验收集中国汉族人群CNV病例490例,PCV病例419例,及正常对照者1316例,收集其外周血标本,提取基因组DNA,针对六个SNP位点采用单碱基延伸法进行基因分型。使用病例-对照相关性分析的方法分别研究这六个SNP位点与CNV及PCV的相关性,并进行对比。研究结果:实验表明,TNXB rs12153855,FKBPL rs9391734 及 SKIV2Lrs429608三个SNP位点与CNV的相关性具有统计学意义(P<0.05)。其中rs12153855(P = 2.8×10-4,OR=1.8)与rs9391734(P=0.001,OR=1.76)为增加CNV易感性的危险因素,而rs429608(P=2.2×10-4,OR = 0.49)为降低CNV易感性的保护因素。此外,单倍体型分析结果表明,由6p21.3区域上的六个SNP位点组成的AGCAGG和AATGAG单倍体型也与CNV存在相关性(P<0.05)。然而,实验结果显示6p21.3区域上的单核苷酸多态性位点及单倍体型与PCV不存在具有统计学意义的相关性(P>0.05)。结论:本实验表明染色体6p21.3区域上的rs12153855,rs9391734及rs429608与CNV相关而与PCV无相关性,为这两种疾病的差异提供了遗传学的证据。6p21.3上的这三个单核苷酸多态性位点有为临床检验上区分CNV和PCV的分子标记提供一定的指导意义。
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