关于产业创新的经济学研究,主要是从稀缺资源配置效率的角度考察产业创新的系统运行规律和战略选择。自熊彼特提出创新理论,创新在促进经济发展方面的作用越来越突出,受到广大学者的普遍关注。但是,绝大数的创新研究只关注制造业,并不重视服务业,研究者只是在最近几年才渐渐认识到服务业有自己的创新。进入21世纪以来,随着中国加入WTO过渡时期的结束,人类进入知识经济时代步伐的加快,提高产业创新能力,建设创新型国家,已成为重要的基本国策。在这一背景下,对制造业创新和服务业创新进行系统的对比,可以更加深入地了解服务业创新,使其避免简单地模仿制造业创新的策略,为中国分别制定两大产业的创新政策奠定理论基础。本文基于创新理论,从服务业与制造业创新过程出发,阐述了两大产业创新的本质都是为了增强竞争力。制造业的创新类型以技术创新为主,包括产品创新与过程创新两个方面,而服务业创新主要以组织创新为主。服务业的产品创新相对于制造业而言,具有无形性、可复制性小、渐进性三个特点。另外,对于制造业来说,顾客不参与到创新过程中,只是创新的接受者,在创新过程中的作用较小。而顾客对服务业创新起到了重要的推动作用。本文运用主成分分析法和DEA方法得出无论是制造业创新还是服务业创新,创新资本与人力资源是主要的影响因素,但是对于制造业创新,创新资本对其影响的作用效果比人力资源大得多。而服务业中,人力资源对创新绩效的影响稍高于创新资本,这是两大产业创新影响因素不同的地方。制造业和服务业的行业平均创新绩效分别为0.548与0.624,两大产业的创新绩效无太大差异,整体创新绩效都不佳,行业内效率差异较大。