产业选择是国家或城市区域未来发展的关键因素，产业发展能否与生态环境相协调是关系到国家或区域未来能否可持续发展的首要问题。主导产业由于其在产业结构中占有较大的比重，对整个国民经济或区域经济的发展和其他产业发展具有较强的驱动或拖后作用，故主导产业的选择就尤为重要。 生态功能区是指具有特定的生态环境、并能对社会经济发挥一定生态可持续支持功能的地理区域。生态功能区以生态建设为主，以遏制生态退化和功能丧失，维护生态平衡，使城市或区域的经济效益、生态效益和社会效益有机协同。生态功能区主导产业的选择，应充分考虑资源、环境对区域和产业发展的约束作用，充分依托区域生境的特征、潜力和社会经济长远发展需要，既能带动其他产业和促进社会经济的发展，又须保障生态的良性循环和环境的安全，以促进区域的可持续发展。 本文在充分借鉴经济学关于主导产业选择理论研究成果的基础上，提出了生态功能区主导产业选择的指导思想——可持续发展和指导原则——循环经济与清洁生产，而后提出了生态功能区主导产业选择标准；然后借鉴和应用战略管理中的钻石理论，构建了生态功能区主导产业选择的理论分析框架、模型，并引入可持续发展评价指标。本文以北京市延庆县为研究，依据上述指导思想和原则，以及构建的理论分析框架和评价指标，对该县的主导产业进行了分析、选择和评价，并提出了实施的应对策略。进而，结合案例分析，探讨了生态功能区主导产业选择的相关规律，完善了其评价指标体系的实践应用，可供其他类型地区研究参考。