计算机快速发展的网络时代，快捷、方便、廉价的数字传输手段为人民获取和交流信息带来了极大便利；同时，计算机应用软件的发展也大大带动了办公自动化的发展进程，信息的传递、共享与收集和办公电子化紧密地结合在一起。作为人类社会不可或缺的信息资源之一的档案，面临着全球信息化趋势的巨大冲击，以计算机技术、通信技术、网络技术以及多媒体技术为基础的网络环境逐渐形成，电子文件的大量产生和应用，使得档案信息迅速地向电子化、数字化、网络化的方向发展。电子、数字、网络的出现，使人们的注意力转移到了“安全”这一词上，于是如何保障电子公文的安全问题就显得日益迫切。确保电子公文在档案管理系统中安全性有着重要的意义。　　 本文主要针对如何采取各种措施保证电子公文在档案管理系统中的真实性、完整性、有效性的问题进行研究。针对此问题，本文构建了基于J2EE的应用开发环境，提出以电子文档格式PDF为研究对象，以电子公文生命周期为整个研究过程，在电子公文传输过程中，在电子公文归档阶段采用“三性保证”和归档电子公文阶段采用“数字签名”以及“元数据嵌入”的设计方案，在某种程度上解决了上述问题。本文以电子公文生命周期为主线，针对真实性，提出“两阶段真实性保证”的解决设想，采用安全性较强的MD5数字摘要算法和利用数字证书进行数学签名相结合的方式来保证；针对完整性，采用将档案文件元数据封装成XML格式，嵌入到PDF的一个文件层的方式来保证；针对有效性，采用判定PDF版本和必输关键字字段的方式来保证。并且在电子公文归档完毕且载入载体后，采取对存放电子文件的载体进行检测的方式来进一步保证电子公文的安全。经过实际研究、设计与开发表明，采用本文提出的方案能够较好的提高电子公文档案管理系统中电子公文的真实性、完整性和有效性，为电子公文系统的研究提供一种新的思路和解决方案。