目前世界正处在科技和产业的大变革时期,习总书记在2018年5月的两院院士大会上指出:“基础研究是整个科学体系的源头,是所有技术问题的总机关”,明确强调了基础研究的引领性作用。根据中国科技统计年鉴,中国的研发投入一直保持着逐年增加的趋势,2007—2016年间,中国的研发投入年均增长14%,与2007年相比,2016年中国的研发投入增长了2.3倍。但根据以往文献和本文测算结果发现:中国的全要素生产率下降趋势明显。为什么逐年增加的研发投入并没有同步促进技术进步?本文选取2007—2016年中国省级面板数据,基于面板数据的固定效应模型,实证检验了不同类型的研发投入对全要素生产率的影响及其地区差异,重点探究了基础研究对全要素生产率的间接影响。研究结果表明:就研发投入的影响效果而言,基础研究、应用研究、试验发展三种研发投入在长期均会显著提升全要素生产率,但对全要素生产率的分解指数产生了不同的影响。就研发投入的地区差异而言,基础研究在促进东部技术进步中发挥作用更为突出,相对而言,应用研究在中部和西部地区、试验发展在西部地区对技术进步的促进效果更显著。就研发投入的交互作用而言,基础研究与应用研究和试验发展之间存在互补关系,基础研究经费投入的增加可以形成知识溢出、提升人力资本和产生发明专利,加快其他研发活动的速度,进而间接影响全要素生产率。对此,本文提出了如下对策建议:一方面应完善研发的支持体系,尤其是强化基础研究的竞争优势,保持其核心地位;另一方面应突出科技政策的地区差异,因地制宜地调整研发投入。现有文献少有从研发投入的分解角度和全要素生产率的分解角度,探讨研发投入影响全要素生产率的机制。通过本文的研究,不仅可以明晰基础研究、应用研究和试验发展对全要素生产率的作用机理,而且可以厘清研发投入存在的结构性弊端,从而有助于解决高研发投入与低全要素生产率并存的矛盾。