本文以大青沟国家级自然保护区为研究对象，分析大青沟自然保护区植物区系的基本组成、植物区系成分的多样性，并整理了保护区珍稀濒危保护植物和内蒙古植物区系大青沟特有植物。大青沟自然保护区有野生维管束植物103科、332属、566种、5亚种、39变种和3变型。其中菊科种类最多，其次为禾本科、豆科、蔷薇科、莎草科、百合科、蓼科、毛茛科、唇形科、藜科等，这十科共占总植物种数的52.03%。最大的属为蒿属，其次为苔草属、蓼属、委陵菜属、堇菜属、柳属、沙参属、拉拉藤属、葱属、鸢尾属，这10个属共占总植物种数的18.43%。大青沟自然保护区植物种类较多，植物区系地理成分较复杂，植物属划分为15个分布类型和12个变型，植物的种划分为19个分布类型和20个变型，区系成分以温带为主。本保护区植物生活型以草本为主，共有513种及种下等级，占保护区总种数的86.62%，水分生态类型以中生植物为主，共有364种及种下等级，占保护区总种数的59.38%。保护区内布着内蒙古植物区系大青沟特有种35种，隶属20科29属，反映了大青沟植物区系对内蒙古植物多样性的影响。与周围邻近植物区系相比较，该保护区与北京喇叭沟门植物区系相似性指数最高，其次为浑善达克、赛罕乌拉和长白山植物区系。整理出保护区内国家和内蒙古珍稀濒危保护植物共36种，隶属24科34属，其中蕨类植物2科、2属、2种，裸子植物1科、1属、1种，被子植物21科、31属、33种。