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菊花（Chrysanthemum morifolium）是我国传统名花，也是世界四大切花之一，其产量和销量均位于世界花卉前列。本研究以目前国内外市场销量最大的切花菊品种‘神马’[Chrysanthemummorflorium（Ramat.） Kitam.‘Jinba’]为材料，利用cDNA-AFLP技术，对不同光周期处理的菊花茎尖基因表达图谱进行分析，分离并鉴定差异表达的基因，通过克隆测序，BLAST分析，获得了6个可能与开花相关的基因片段，为从分子水平上了解菊花花芽分化的分子机理，通过基因工程技术培育不同目标花期的菊花新品种奠定基础。主要研究成果如下：1、建立了适合菊花的cDNA-AFLP分析体系TRNzol法提取的RNA较完整，纯度较高；采用Oligo（dT）18Primer及经过改造和优化的BeyoRT M-MuLV反转录酶得到ds cDNA，将1μg的cDNA利用EcoR Ⅰ/MseⅠ快速双酶切5min，连接产物稀释10倍作为预扩增反应的模板，扩增30个循环，其检测结果较理想；预扩增产物稀释50倍作为模板，采用Touchdown程序，选用64对AFLP引物进行选择性扩增；扩增产物经6%的PAGE电泳后采用改进的快速银染体系，得到了清晰可辨的cDNA-AFLP凝胶图谱。本研究建立的反应体系适用于菊花功能基因的cDNA-AFLP研究。2、利用所建立的cDNA-AFLP技术体系，筛选菊花开花相关基因64对引物组合检测到2917个cDNA片段，获得差异表达的TDF共835个，其中584个为上调表达，251个为下调表达。对克隆测序成功的50个差异表达TDF进行分析，结果表明，36个TDF可以在NCBI数据库中找到同源序列。其中31个TDF为已知功能的基因（dbEST登录号：JG700127-JG700157），5个TDF未找到同源序列。按照其功能分类，将31个差异表达基因分为7类：信号转导、分化发育、转录调控、蛋白质代谢、能量与代谢、抗病与防御等相关基因、未知或假定蛋白基因及未知基因。3、6个与开花相关的TDF的RT-PCR验证对选取的6个与开花相关的TDF进行半定量RT-PCR验证，结果表明，6个基因片段在短日照条件下均特异表达或表达上调，而在长日照下均未见表达或表达下调，这与cDNA-AFLP表达谱结果相一致。本研究利用cDNA-AFLP技术筛选了菊花花芽分化期多个与菊花开花相关的基因片段，这些基因片段将进一步用于功能鉴定和转基因利用。