蝴蝶的色彩及形态多样，是研究自然界物种表型多态性的良好实验材料。我们对柑橘凤蝶（Papilioxuthus）和金凤蝶（Papiliomachaon）进行了基因组测序和从头组装(denovoassembly)，拟为蝴蝶成为模式生物提供更清晰的遗传背景。通过对两种凤蝶基因组大小的Kmer估计，我们发现柑橘凤蝶杂合度过高、无法进行后续基因组的组装，所以我们对柑橘凤蝶进行了近交饲养，将近交饲养的第三代至第五代的成虫样品用于基因组测序。我们采用454和IlluminaHiseq2000测序技术相结合，获得了柑橘凤蝶和金凤蝶覆盖度为150乘以上的基因组序列数据，组装好的柑橘凤蝶和金凤蝶基因组分别含有15322和15499个基因。在此期间我们也对柑橘凤蝶和金凤蝶进行了常规饲养观察、对其生活史各阶段和表型进行了详细记录，为后续蝴蝶的表型及功能研究提供实验材料的背景知识。我们经过对柑橘凤蝶和金凤蝶基因组测序和饲养观察，使蝴蝶向成为表型研究的模式生物更靠近一步。