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罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)是国内主要的淡水虾养殖品。当前,我国罗氏沼虾种苗繁育和养殖技术达到国际先进水平,但仍存在规格不均、个体小型化、产量低下等问题,严重制约着我国罗氏沼虾养殖业优质、高效地发展。因此,开展罗氏沼虾生长性状候选基因的研究,明确其表达规律,可为进一步探究候选基因在生长发育过程中的调控机制提供依据。以孟加拉群体为基础群,构建20个全同胞家系,比较其生长性状,筛选出生长快速家系(fast-growing group,FG)和生长慢速家系(slow-growing group,SG);选取胰蛋白酶(Trypsin,TRY)、淀粉酶(Amylase,AMY)、组织蛋白酶L(Cathepsin,CaTL)、肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)、维甲酸X受体(Retinoid X receptor,RXR)、Ras相关蛋白(Ras-related nuclear protein,Ran)、热休克蛋白 90(Heat shock protein 90,HSP90)和蜕皮激素受体(Ecdysone receptor,EcR)8个与生长性状相关的候选基因进行克隆和生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR方法对其mRNA表达规律进行研究。获得的主要结果如下:(1)以引进的罗氏沼虾孟加拉群体为基础群,构建了 20个全同胞家系,生长性状比较结果表明:这20个家系的生长速度差异显著,其中家系19平均体重最高,家系18平均体长最长;从中筛选出5个生长快速家系(家系6、11、16、18、19)和5个生长慢速家系(家系1、3、8、9、15)。进一步比较分析发现FG的体重、体长、头胸甲长、头胸甲宽、腹节长和腹节宽极显著高于SG(P<0.01)。(2)以肝胰腺组织为试验材料,成功克隆了罗氏沼虾TRY、AMY、CaTL、MSTN、RXR、Ran、HSP90和EcR的编码区序列,各CDS区全长分别为:801bp、2120bp、1029bp、1380bp、1346bp、648bp、2181bp和 1716bp;编码氨基酸数分别为266、706、342、459、448、215、726和571个;氨基酸序列同源性比对结果显示,罗氏沼虾TRY、AMY、CaTL和EcR分别有1处(c.C589T致p.Phe298Leu)、1处(c.G246A致 p.Tyr84Cys)、2 处(c.T299C 致 p.Ile100Thr 和 c.A503G 致p.Asn168Asp)和 1处(C.A897G致p.Ile298Val)处碱基发生变化,HSP90基因有9处氨基酸序列发生改变,Ran氨基酸序列与NCBI提供的序列一致;罗氏沼虾MSTN和RXR与日本沼虾的氨基酸序列比对发现一共有15和21处氨基酸不同。(3)采用RT-PCR技术,以罗氏沼虾(♀和♂)性腺、肝胰腺、肌肉、鳃、胃、心脏、肠和腹节神经8个组织为供试材料,检测其组织表达谱,结果显示:TRY和AMY基因在罗氏沼虾(♀和♂)肝胰腺中表达量最高,在肌肉表达量最低;CaTL基因在雄虾肝胰腺中表达量最高;在雌虾鳃中较高表达,在腹节神经中低表达。MSTN基因在心脏(♀和♂)中表达量最高,在胃(♂)和肌肉(♀)中低表达。RXR基因分别在鳃(♂)和卵巢(♀)中的表达量最高,在肠(♂)和肝胰腺(早)中表达量最低;Ran基因高表达于性腺组织中,分别低表达与肠(♂)和胃(♀)中;HSP90基因在肝胰腺(♂)和心脏组织(♀)中高表达,在肌肉(♀和♂)中低表达;EcR基因在鳃(♂)和卵巢组织(♀)中呈高表达模式,在肌肉(♂)和腹节神经(♀)中呈低表达模式。(4)为进一步研究8个生长性状候选基因的表达规律,采集FG和SG家系中各8个体的肌肉组织进行RT-PCR实验,结果显示:TRY、AMF、CaTL、HSP90和EcR基因在FG中的表达量极显著或显著高于在SG中的表达(P<0.01或P<0.05),MSTN基因在FG中的表达量极显著低于在SG中的表达(P<0.01),RXR、Ran基因在两组中的表达量差异不显著(P>0.05)。