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水受限在纳米尺度的孔道中表现出与宏观体相水(bulk water)不一样的性质,其具体微观运动规律与机制引起了广泛的兴趣。在特定半径的纳米通道中,水分子是以单分子链的形式排列,它们通过氢键网络联系在一起,做协调一致的运动。如果改变纳米通道的半径或纳米通道与水之间的相互作用,将引起纳米通道内的液汽相变和开状态与关状态的转换。另外,在纳米通道中水的密度分布常呈现出驻波状分布,发生在纳米尺度下的这些有趣现象背后的规律与机制至今还不是很清楚。研究这些水在纳米尺度通道中发生的有趣现象背后的规律与机制,对人们理解许多重要的纳米孔道中溶液输运过程非常有帮助,也有助于对某些生物水通道的结构和功能的理解。
然而,许多纳米通道系统是极其复杂的,比如生物水通道。直接研究纳米尺度的生物水通道中水的特殊行为的分子机制很不容易。近年来,基于纳米碳管(CNT)的纳米通道,被广泛用于生物水通道蛋白的模型系统,来研究生物水通道蛋白的一些基本规律。本文作者以直径为8.1 A的(6,6)碳纳米管为模型,主要研究了一维水链在纳米通道中的性质。生物水通道对水通透的调控主要通过两种手段:改变通道几何形状和电荷的分布(带电残基的位置)。本博士论文主要通过挤压改变碳管几何形状和通过外加电荷并改变其位置等手段,集中研究了通道几何形状和电荷位置的改变对水行为的影响。
跟本课题组万荣正等人合作,本文作者用分子动力学模拟对碳纳米管受不同形变情况下管内水分子的性质进行研究,发现了良好开关特征。而开关性质与抗干扰能力发现与水分子的驻波状密度分布有关联,但是,其具体物理机制还不是很清楚。在此基础上,本文作者对其进行了更深入和系统地研究。
对宏观上的管道来说,如果两边没有压力差,水在里面的分布是均匀的,而在受限的直径为8.1 A,长为13.4 A的纳米管道中水的密度分布却表现出驻波状分布。当本文作者加长碳纳米管1.2 A,驻波状又变弱,特别在中部几乎消失,而当碳纳米管受压变形后驻波状又重新出现。这就引起对水在碳纳米管中的波形分布产生机制的更大兴趣。当碳管长度增加水的密度分布会怎样变化?其良好的开关机制还存在吗?计算机模拟发现开关机制并没有受长度的变化受明显的影响,同时,本文作者提出了一个简单的理论模型探讨了驻波状密度分布的物理根源,解释了这些有趣的密度变化现象。通过计算机模拟与理论分析得出结论是:水分子在纳米孔道中呈驻波状分布的原因主要是氢键与纳米管的约束。我们的研究结果有助于理解在生物水通道和其他纳米通道中类似的现象。
为了考察这种开关机制的抗干扰能力,本文作者用分子动力学模拟了外部周期性扰动对纳米管中一维水链的运动的影响。结果发现存在一个临界频率fc(大约为1333 GHz),它对水在碳纳米管中输运性质起了比较重要的作用。当外部扰动频率小于1333GHz时,其水流通量flow、净流量flux、氢键数目、水链的翻转频率几乎不受外部扰动影响,说明碳纳米管中的一维水链的运动具有很好的抗干扰能力。对外部扰动有如此好的屏蔽效果,主要是因为纳米管中的一维水链通过较强的氢键相连。本文作者的研究讨论可能对理解生物系统为什么能够在充满噪音的环境中精确实现信号传输有帮助。
本文作者还用Fokker-Planck方程对(6,6)碳纳米管中一维水链的输运性质进行了研究。探讨了Fokker-Planck方程在纳米尺度的有效性。通过与模拟结果比较,发现Fokker-Planck方程在一定程度上能基本刻画碳管形变对一维水链运动的调控,同时从另外方面进一步说明了本文作者的模拟得到的良好开关行为规律是可靠的。另外,还探讨了流量随外部渗透压变化的规律。
为了定量研究外部电荷对水链在纳米管中的运动行为影响,与李敬源等人合作我们一起构造了一个由单个纳米碳管(CNT)和单个外加电荷组成的模型系统。研究了通过调节外加电荷和碳管的不同距离对纳米通道中的水分子行为进行调控。