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MicroRNAs作为一种小的非编码RNAs在转录后水平调控基因的表达。已知microRNAs倾向于以聚集形式存在，且聚集的microRNAs通常具有协同的调控模式。与转录因子类似，microRNAs在很多生物学过程中起重要作用，如细胞发育、细胞分化等。生物调控网络中转录因子的功能已被广泛研究，然而如何在大规模的整合的调控网络背景下研究microRNAs和转录因子的功能协同性仍然不清晰。本论文中，我们以冠心病为例，通过构造由转录因子、microRNAs和非转录因子靶基因组成的整合的协同调控网络，并结合基因表达谱，利用迪科斯彻最短路径算法从此网络中筛选出具有不同调控结构的模块。最终，我们获得67个显著的调控模块，其中11个模块同时存在microRNA及转录因子的协同调控模式，54个模块只存在microRNA-靶基因的转录后调控模式，还有2个模块只存在蛋白质-蛋白质互作关系模式。相比于平均层次聚类算法和马尔科夫聚类算法，我们的方法能够展现更好的结果。后续的功能注释和文献证实表明，我们的方法能够检测出包含在冠心病特异生物学过程中的功能相关调控模块。