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精神分裂症（Schizophrenia，SZ）与双相情感障碍(Bipolar Disorder，BP)是重要的精神类遗传性疾病，越来越多的研究证实DNA甲基化在这些疾病的发生发展中发挥着重要的调控作用。因此，在全基因组水平研究精神类疾病的DNA甲基化模式具有重要的研究意义，可以为阐明精神类疾病的致病机理提供重要参考，为识别精神类疾病相关的异常甲基化基因以及精神类疾病的预防和治疗提供理论支持。 在本研究中，我们利用高通量的测序方法对来自拉丁美洲人群中SZ、BP以及正常个体的外周血样本进行了全基因组水平的DNA甲基化检测与分析。首先，我们在SZ和BP中识别了大量的差异甲基化区域(Differentially MethylatedRegions，DMR)，发现这些DMR多数位于基因的功能元件上，包括启动子，3-UTR和5-UTR等。其次，我们发现启动子在转录起始位点周围具有5种异常的甲基化模式，证实了异常甲基化不仅发生在CpG岛(CGI)，也倾向于发生在CGI侧翼区域以及没有CGI的启动子区域。通过对不同启动子异常甲基化模式的基因进行通路富集分析，我们发现这些异常甲基化的基因显著富集在精神障碍和神经发育相关的生物学通路上，包括MAPK信号通路、神经受体-配体互作通路以及轴突传导通路等。此外，我们利用高通量测序检测了基因表达数据，证实在SZ中启动子异常甲基化与转录调控显著相关，还发现启动子CpG岛超甲基化与基因表达的抑制显著相关，并且在CGI3岸的低甲基化与基因的高表达密切相关。最后，我们发现SZ和BP疾病具有共同的表达模式和分子机制，利用差异表达基因和差异甲基化区域可以显著区分疾病和正常样本，提示SZ和BP特异的DNA甲基化可以作为潜在的生物标志物，具有重要的临床应用价值。综上，本研究对精神类疾病中异常的甲基化模式进行了全面的分析，为精神类疾病提供了异常甲基化的精确基因组位置，并识别了异常甲基化的候选基因以及影响的生物学功能，可以为精神类疾病的分子机制研究和临床应用提供新的参考。