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本试验以中国美利奴羊(新疆型)(ZM)、中国美利奴羊(新疆型)与德国美利奴羊杂交后代(ZD)、中国美利奴羊(新疆型)与萨福克羊的杂交后代(ZS)为研究对象,选取8个微卫星标记(MAF70、 BM1824、OARHH35、OARJMP8、BMS1248、MCM38、BMS648、ETH225),采用微卫星标记技术,检测中国美利奴羊(新疆型)及其杂交群体的遗传多态性,运用最小二乘线性模型,对所检测到的多态标记与生产性状进行关联分析。旨在为中国美利奴羊(新疆型)的杂种优势利用、杂交后代分子标记辅助选择育种提供试验依据。结果如下：1.通过对中国关利奴羊(新疆型)及其与德国美利奴羊、萨福克羊的杂交后代的生产性状进行分析表明：ZD和ZS的剪毛后体重、三月龄重、六月龄重极显著高于ZM(p<0.01),ZD和ZS的剪毛量极显著低于ZM(p<0.01),ZS的胸围极显著高于ZM,ZS的细度显著高于ZM,净毛率极显著低于ZM(p<0.01)；两个杂种后代在产肉性能上具有明显的杂种优势,中萨比中德更高；但是中萨的羊毛品质具有一定的劣势。2.对中国美利奴羊(新疆型)及其与德国美利奴羊、萨福克羊的杂交后代8个微卫星标记上的分析：所选8个微卫星标记在3个绵羊群体中进行多态性检测,均得到了特异性扩增结果,共检测到58个等位基因,平均每个位点的等位基因数为7.3个,其中MCM38标记的等位基因数在中国美利奴羊(新疆型)与德国美利奴羊的杂交后代群体中最多,为9个；OARJMP8标记在3个群体最少只有5个。均多于4个等位基因,可用于这3个绵羊群体的遗传多样性分析。所选的8个微卫星标记在3个绵羊群体中的平均有效等位基因数分别为：5.7431、5.8248、5.6110;平均杂合度分别为：0.8101、0.8229、0.8192;平均多态信息含量分别为：0.8078、0.7982、0.7947,均为高度多态标记(PIC>0.5),表明3个绵羊群体的遗传变异程度大,遗传多样性丰富,这8个微卫星标记可以用于中国美利奴羊(新疆型)及其杂交后代遗传多样性和生产性状的相关分析。3.对8个多态微卫星标记部分基因型与3个绵羊群体生产性状进行关联分析,结果表明：羊毛性状：剪毛量,ZM群内,BMS648标记的CG基因型个体显著高于其他基因型个体(p<0.05),ZD群内,OARJMP8标记的AD基因型个体显著高于CE基因型个体(p<0.05),BMS1248标记的CG基因型个体的显著低于其他基因型个体(p<0.05)；净毛率,ZM群内,OARHH35标记的CE基因型个体显著高于AF基因型个体(P<0.05)、BMS648标记的BB基因型个体显著高于其他基因型个体(p<0.05),ZD群内,OARHH35标记的DF基因型个体显著高于BG基因型个体(p<0.05)。BMS648, OARJMP8、BMS1248可望作为绵羊剪毛量选择的分子标记,OARHH35、BMS648标记可望作为绵羊净毛率选择的分子标记。不同生长阶段的体重：剪毛后体重,ZD群内,BMS1248标记的DH基因型个体显著高于其他基因型个体(p<0.05)；三月龄体重,ZD群内,ETH225标记的DD基因型个体显著高于CC基因型个体(p<0.05),ZS群内,MAF70标记的BD基因型个体显著高于BG基因型个体(p<0.05)。BMS1248可望作为绵羊剪毛后体重选择的分子标记,ETH225、MAF70可望作为绵羊三月龄体重选择的分子标记。