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卟啉化合物在仿生催化等领域得到了广泛的应用。但由于目前实验方法的不足以及实验条件的限制，人们对卟啉仿生催化剂的研究仍然存在着许多未知或不是十分清楚的问题。分子模拟的方法可以摆脱某些实验条件的限制，直观地预测卟啉的结构及特性，指导新型卟啉化合物的合成。本文应用分子动力学和量子化学方法对卟啉仿生催化剂的结构和性质进行了研究，主要内容包括：
1．采用分子动力学方法研究了环糊精—卟啉与一系列二苯乙烯衍生物所形成的包结物，并考察了包结物的稳定性对环糊精—卟啉催化选择性的影响。结果表明，包结物越稳定，越有利于环糊精—卟啉对二苯乙烯进行选择性催化环氧化。
2．采用分子动力学方法研究了meso-四-(4-磺酸基苯基)-卟啉TPPS4)二聚体的形成，并用自适应偏置力方法计算了TPPS4形成二聚物的过程中自由能随反应路径的变化。结果表明，在中性水溶液中，卟啉难以聚集，而在酸性条件下发生质子化后，TPPS4易形成二聚体。
3．采用密度泛函方法研究了自旋多重度对氯化四苯基锰III卟啉结构的影响。结果表明，对氯化四苯基锰III卟啉，自旋多重度为5时的结构最稳定。