政府性基金作为我国财政收入的重要组成部分,长久以来为我国特定事业的发展提供了可靠的资金支持,是我国改革开放以来国家建设的重要经济来源,在我国经济发展史上有着举足轻重的作用。港口建设费是我国政府性基金中的一项,自1986年起开始试征收,其征收目的主要是加强港口建设和增加船舶运力,以适应国民经济的加速发展。开征20多年来,港口建设费为我国水运行业的长足发展提供了有效的财政支持。但是,随着社会的发展,港口建设费的征收管理机制与水运经济发展的矛盾日渐凸现,征收管理工作中的困难也越来越多,越来越显著。对此征收管理机制的改革有成效也有不足,进一步深化这一改革已经到势在必行之时。上海港作为国内港口的龙头老大,其港口建设费征收管理工作在全国具有一定的代表性。本文以上海港为例,探析深化征管机制改革的必要性,探讨深化改革的路径,探究深化改革的难点和条件,试图对全国范围内进一步深化港口建设费征管机制改革提供若干启示。