税务稽查作为税收征管工作的重要组成部分，坚守着税收征管的最后一道防线，承担着堵漏征收、打击税收违法犯罪的职能，为维护税法的权威、营造公平有序的税收环境发挥着至关重要的作用。2018年3月13日，十三届全国人大一次会议关于国务院机构改革方案的说明第二点第十一条指出，“改革国税地税征管体制。将省级和省级以下国税地税机构合并，具体承担所辖区域内的各项税收、非税收入征管等职责。国税地税机构合并后，实行以国家税务总局为主与省(区、市)人民政府双重领导管理体制。”由此，我国开启了税制机构改革新篇章，并在此契机下完成了稽查机构改革，即在撤销县级税务稽查局基础上，建立以跨区域稽查局为主的稽查系统,一定程度提升了稽查层次，整体提高了税务稽查质效。但税务稽查新的管理模式和工作思路还有待开发运用，稽查部门应尽快转变原有工作管理模式，以崭新的姿态积极投入到今后的工作当中。
　　本论文研究内容是，一是介绍跨区域税务稽查的相关概念，阐述跨区域税务稽查模式形成的背景和存在的意义；二是以吉安市跨区域税务稽查现状为例，从现状分析、问题研究两个方面对吉安市跨区域税务稽查的概况、改革实践成果进行深入剖析，系统全面梳理我国税制机构改革后跨区域税务稽查改革实践中出现的案源分配机制不合理、国地税业务缺乏融合、稽查人力资源不配套、审理岗职责划分不清以及稽查经费独立权被上收的问题；三是结合国内广东、浙江等发达地区的税务稽查改革实践经验基础，因地制宜的从案源分配、业务融合、人才队伍、审理职责及稽查经费等方面，有针对性的提出保障稽查队伍数量与质量、加速国地税业务融合、优化稽查案源推送机制、明确审理岗位职责及灵活稽查经费管理这几个方面的具体措施建议。本论文研究方法主要包括，一是文献研究法，将国内外专家学者的研究资料、研究成果进行梳理提炼，为本论文的整体构架及论点提供了支撑；二是对比分析法，纵向掌握我国税务稽查模式的演化历程及跨区域税务稽查的发展现状，横向将吉安市跨区域税务稽查与国内其他发达地区跨区域税务稽查进行比较，分析各自具备的优势和存在的不足；三是总结归纳法，结合本区域实际工作开展情况，深入探究当前吉安市跨区域税务稽查工作问题所在，并总结归纳出当前全国跨区域税务稽查不足的共性之处，为跨区域税务稽查未来的发展道路提供有价值、有指导性的意见和建议。
　　跨区域税务稽查模式是当前一项崭新的课题，同以往任何时期都不同，再加上新的税务稽查机构成立时间较短，现在对于税制机构改革后如何更好的发挥跨区域税务稽查质效的研究并不多，现有的研究要么是在税务稽查模式改革之前，主要集中在理论研究，缺乏跨区域税务稽查的经验数据，要么研究的是跨区域税务稽查的起步阶段，时间太短，成效不太显著。本文则在跨区域税务稽查实际运转近两年后，通过以吉安市跨区域税务稽查为实例，结合本人在税务系统从事基层稽查工作的实践和经历对此项课题开展研究。期望通过行之有效的措施建议实现吉安市跨区域税务稽查质效的最优化，也借此总结出值得借鉴的经验并提出更合实际、可操作的有效建议，为跨区域税务稽查的学术研究提供一定的参考资料。