基于mtDNA序列的中华蜜蜂群体遗传结构分析

来源 :陕西师范大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:net_worm
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中华蜜蜂(Apis cerana cerana)隶属于膜翅目(Hymenoptera)、蜜蜂总科(Apoidea)、蜜蜂亚科(Apidae)、蜜蜂属(Apis),是一种兼具经济、社会和生态价值的昆虫。本研究采用线粒体DNA(mtDNA)tRNAMet~tRNAGln基因、COI基因和Cytb基因作为分子标记对分布于我国18个省市30个地理种群的中华蜜蜂进行群体遗传结构分析,进一步较为系统地了解中华蜜蜂的群体遗传结构和遗传分化状况,为中华蜜蜂资源保护和合理利用提供更为丰富的分子理论依据。主要研究结果如下:1.共测了 30个地理种群的150只中华蜜蜂个体,获得了 232 bp的tRNAMet~tRNAGln基因序列、762 bp的COI基因序列和572 bp的Cytb基因序列,3个基因拼接后的联合基因tRNAMet~tRNAGln+COI+Cytb大小为1566 bp。在1566 bp的联合基因序列中,固定位点、变异位点、简约信息位点和单变异位点数分别为1392、173、69和104。在tRNAMet~tRNAGln基因、COI基因、Cytb基因和3基因拼接后的联合基因片段中检测到的单倍型数依次为48,37、46和75。对各基因序列进行碱基组成分析,发现A+T的含量很明显高于G+C含量,表现出碱基组成的偏倚性。在各基因序列的碱基组成中,tRNAMet~tRNAGln基因序列的A+T含量相对较高,达到了 89.15%,是mtDNA中的一段AT富含区。对中华蜜蜂各地理种群的单倍型多样性及单倍型数目进行分析统计,发现30个地理种群的总体单倍型多样性为0.981,总体核苷酸多样性为0.0051。其中甘肃定西、甘肃岷县、青海民和、贵州遵义和广西平果等地理种群均只有一种单倍型,而陕西黄龙、陕西宝鸡、云南曲靖和广东韶关等地理种群的单倍型多样性都较高。2.对30个地理种群中华蜜蜂联合基因tRNAMet~tRNAGln+COI+Cytb进行分子变异分析(AMOVA),结果表明,所研究的30个地理种群的中华蜜蜂种群间变异占总变异的62.48%,种群内的变异占总变异的37.52%,可见中华蜜蜂的变异主要来源于群体之间。中华蜜蜂各个地理种群之间的遗传分化系数(Fst)介于0.014~0.965之间,大部分群体间的遗传分化达到了显著水平,说明大部分中华蜜蜂种群间发生了不同程度的遗传分化。对各地区中华蜜蜂两两之间的遗传距离进行计算,结果显示,各地理种群之间的遗传距离介于0.001~0.034之间,其中海南3个地区中华蜜蜂之间的遗传距离较近,介于0.003~0.005之间,而海南与大陆其他地区中华蜜蜂之间的遗传距离较远,介于0.009~0.015之间,海南岛岛屿隔离效应较为明显。大陆其他中华蜜蜂种群之间的遗传距离都比较近,介于0.001~0.005之间。中华蜜蜂各地理种群间的遗传距离与地理距离不存在明显的相关性,地理上的距离远近并不是影响中华蜜蜂各个种群间遗传结构的决定因素。3.基于tRNAMet~tRNAGln基因序列和tRNAMet~tRNAGln+COI+Cytb联合基因序列单倍型对30个地理种群的中华蜜蜂构建系统发育树和网络图。结果表明,仅有海南、西藏和四川马尔康(阿坝地区)三个地区的中华蜜蜂能够按照相应地理区域分别聚为一支,而其他地区的中华蜜蜂聚类结果相对比较混乱,未能按照相应地理区域有规律地划分开来,可见海南、西藏和四川阿坝这3个地区的中华蜜蜂类型较为特殊。其中海南中华蜜蜂与其他地区聚类分支最为明显,且与其他中华蜜蜂的遗传距离最大,海南中华蜜蜂是一个特殊的地理种群。西藏中华蜜蜂与四川阿坝中华蜜蜂虽各自单独聚为一支,但与其他地理种群遗传距离相对较近,因此认为西藏与四川阿坝中华蜜蜂可能属于特殊地理环境下形成的中华蜜蜂类型。总体看来,系统发育树显示的拓扑结构未能将大部分中华蜜蜂种群按照前人研究所划分的亚种或生态型有规律地进行聚类,中华蜜蜂表现出复杂多样的起源关系,有关中华蜜蜂起源进化方面的研究还有待进一步深入。4.本研究利用mtDNA tRNAMet~tRNAGln对中华蜜蜂进行遗传多样性及遗传结构分析,并构建系统发育树对中华蜜蜂遗传分化状况进行分析,结果认为tRNAMet~tRNAGln基因相对其他两种线粒体基因含有更为丰富的遗传变异信息,比较适合用于中华蜜蜂群体遗传多样性研究,但是否可以有效地用于解决中华蜜蜂的种下遗传分化问题还有待进一步验证探讨。
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