阴阳是中医基础理论中最核心的概念,贯穿于中医理论体系的方方面面。本论文从三个方面对中医阴阳学说进行研究：上篇集中讨论中医阴阳的本质及数学特性。这是本论文最核心的内容。其中又分为四章：第1章讨论中医阴阳的本质及基本数学特性。论文从阴阳的本义出发出发,区分了“抽象阴阳”与“具体阴阳”。其中,“抽象阴阳”是抽象意义上的阴阳,所指无定在,比较模糊笼统；“具体阴阳”是具体属性上的阴阳,所指明确,可以测量,具有确定性和可判定性。阴阳是相对的,互为前提而存在,在这个角度上说,阴阳是一种二元关系。作为二元关系,阴阳具有反自反性、反对称性和可传递性等数学特性。事物的属性可划分为两种类型,一种数值大者为阳(比如温度),可称之为“阳属性”；一种数值大者为阴(比如湿度),可称之为“阴属性”。基于此,本文详细讨论了中医阴阳虚实的含义及度量方法。第2章对经典中医体系中最重要的几种“具体阴阳”进行深入分析。(1)寒热之阴阳。寒热是中医“八纲辨证”中的两纲,也是中医临床最关注的症候之一。中医学中的寒热,主要包括气候的寒热、症状的寒热和药性的寒热。而这些“寒热”概念,有时候是客观的温度冷热(如气温高低,体温高低),而更多的时候则是指医者或病者的主观感觉。由于主观感觉与客观温度的不一致性,导致了“寒热真假”及“药性悖论”等问题。文章还探讨了各种寒热的测量方法。(2)空间之阴阳。空间位置之阴阳,主要考虑四种位置关系：左右、前后、上下、外内。文中详细讨论了这四种位置阴阳及“左血右气”、“男左女右”、“左升右降”等说法之间存在的逻辑问题。文中还给出了空间阴阳的数学表示。(3)气味之阴阳。气味是传统中医药性理论中最核心的概念。以气味分阴阳,则有气与气相对之阴阳、有味与味相对之阴阳、也有气味相对之阴阳。气味各有厚薄,气味因其厚薄又可以各分阴阳。这些问题盘根错节,又十分重要。经典中医理论中关于气味阴阳理论的论述中存在着众多的问题。其中,气、味之阴阳方面的问题主要有四个；气味之厚薄及其阴阳方面的问题主要有八个。这些问题长期未能引起学术界应有的关注。(4)清浊之阴阳。清浊是经典中医里非常重要的概念。清升浊降,从类比自然界中的浮力现象而来。根据浮力原理,药物在人体里上升还是下降,应该只与该药物的密度(轻重)有关,而跟用量无关；而升提或下降之(?)的大小,则与该药物的密度和用量有关。而根据清轻者为阳主升的假设,药物在人体里上升还是下降,不仅与该药物的密度有关,还取决于用量,二者产生了矛盾。本文对此矛盾进行了深入分析。除此以外,本章还讨论了营卫阴阳和脏腑阴阳中的问题。第3章把阴阳的二元关系进行了扩展,讨论集合之间阴阳的判定方法,并讨论了“一分为二”和“一分为三’’的异同。研究表明,“一分为二”是“一分为三”的一种特例。第4章把用于描述单个属性的“具体阴阳”进行扩展,提出了“复合阴阳”和“属性向量”的概念,用于描述一个具有多个属性的事物的整体阴阳。并初步讨论了“复合阴阳”在描述人体健康、单味中药药性和药方功用上的应用。到此,我们实现了三个目标：1)给出对阴阳的严格数学定义。2)由阴阳的数学定义,推导出阴阳的数学特性。3)建立一个能够同时用于描述人体阴阳、疾病模型、药物模型和药方模型的数学模型。中篇讨论中医阴阳的相互关系。具体分两章：第5章,讨论阴阳的相互关系。阴阳的相互关系是阴阳学说的核心内容。由于对阴阳的实质认识不清,未能区分“抽象阴阳”与“具体阴阳”,故学术界对阴阳的关系认识至今仍然属于比较“混沌”的状态。本章从四个方面对阴阳的关系进行了分析。(1)单个属性上的阴阳关系。传统所说的对立制约、互根互用、相互转化一般都是单个属性上阴阳双方之间的关系。(2)不同属性间的阴阳关系。事物的多个属性之间,可能存在正相关、逆相关、函数相关和不相关关系。文中指出,“阳生阴长”和“阳杀阴藏”只是不同属性间的一种可能的正相关关系。同样地“阳长阴消”和“阳消阴长”也是只是不同属性间的一种可能的逆相关关系。故不能简单地认为,人体里任何两种阴阳会存在“阳生阴长”或“阳长阴消”的规律,而需要在实际情况中具体分析。(3)人体阴阳与外界阴阳的关系。人体阴阳与外界阴阳,既可能同步消长,也可能反向消长；同样地,人体阴阳与药物阴阳,既可能同步消长,也可能反向消长。这些都要求我在运用阴阳学说时,具体情况具体分析。(4)阴阳平衡。所谓的阴阳平衡,在单一属性上看,就是该属性既不是阳虚,也不是阳实,既不是阴虚,也不是阴实的状态。所谓事物A的阴阳平衡,就是指事物A的每个独立的属性皆处于阴阳平衡的状态。第6章,讨论扶阳与滋阴学派之争。阴阳是中医学的根本,而扶阳与滋阴,也是中医学界永恒的争论。本章中,我们对扶阳和滋阴二派进行了界定,并详细讨论了二派的主要源流、主要医家及其特色。归纳起来,两派论争的焦点有三：1)阴阳贵贱与主从关系；2)阳虚与阴虚之病孰少孰多?3)阳虚和阴虚之病该如何调治?本研究认为,这些问题之所以长期争论不休,无法达成一致,主要原因有二：1)是论证问题的方法有误。古代医家论证问题,主要采用如下几种方式：取类比象、诉诸权威、诉诸实例、诉诸中庸、诉诸情绪、人身攻击等等。这些都不是科学和有效的论证方式,当然也就无法得到可靠的结论。2)是二派对阴阳内涵的认识不清,未能区分“抽象阴阳”和“具体阴阳”。由于抽象阴阳“所指无定在”,容易“蒙混”,故二派之间的争论,往往也是蒙混不清的。如果能够区分“具体阴阳”,将不难发现,在人体的任何一个属性上,唯有阴阳平衡,才是健康状态,偏阴偏阳,皆属病态。另外,本文还提出四种假说,来解释为何两种相反的意见能够常期并存：(1)病人正反馈说。(2)病人选择说。(3)师承授受说。(4)同病异治说。下篇讨论了与阴阳相关的三个重要概念：气、四象和五行。相对上篇和中篇来说,下篇相对次要一些。本篇有几个地方值得关注：第7章,讨论气与阴阳相关的问题。第7.2节专门讨论气化学说的气化动力问题。“气化”不会无缘无故的发生,它需要动力,这就是所谓的“气化动力”问题。这个问题,以前很少有学者注意,更没有系统研究。本论文对此问题进行了较深入的探讨。第8章讨论阴阳与四象相关的问题。提出了四季配四象分太少阴阳的两种方式：“正统四象说”和“医家四象说”。因为对阴阳的定义不同,故二者所描述的阴阳变化规律有异。另外,本文还探讨了《内经》五脏与“四象”的两种配属方式背后的逻辑,从而证明,基于“正统四象说”的配属方法更为本源。第9章中,讨论阴阳与五行相关的问题。最值得关注的是有关五行生克内涵的辨析。目前中医学界的主流认识,倾向于把相生定义为促进作用,把相克定义为制约作用。这种定义并不完全合理。相生的涵义有两层：第一层,是时间、空间和属性上的相续；第二层,才是促进作用。相克的涵义也有两层：第一层,是时间、空间和属性上的相离和对待；第二层,才是抑制作用。第一层涵义是本质的、绝对的,第二层涵义则是派生的、相对的。相生强调的是相续和同一,而相克强调的则是相离和差别。正确认识相生相克的涵义,对完善中医基础理论,避免逻辑混乱具有重要意义。