高校的科研水平是一国科学技术实力的重要标志，高校的科研活动既能为提高教学质量、培养高层次人才创造基础条件，又能为社会经济发展提供最新的科技成果。高校的科研成果作为科研劳动的结晶，对其进行科学评价不仅是科研管理工作的重要组成部分，又是监督、导向、反馈高校科研工作的重要手段。本文首先对国内外高校科研成果评价相关研究进行梳理，阐述了平衡计分卡（Balanced Score Card，简称BSC）的相关理论，对其评价高校科研成果的可行性进行了分析。其次，构建基于平衡计分卡的高校科研成果评价指标体系，在明确评价目标、指标选取原则的基础上，借鉴BSC模型，结合高校科研成果评价的特点对BSC的四个维度进行修正，构造了科研经费、社会评价及认可度、科研实力、学习与成长四个层面，共18个主要评价指标。再次，采取层次分析法确定指标的权重，收集相关指标数据，确定评价标准，构建出具体的评价指标体系。最后，以F大学为案例，对F大学科研成果进行评价，并根据评价结果提出相关对策建议。本文的创新点在于借鉴BSC的功能和结构，将高校的战略设定与科研成果评价有机结合，构建出适应高校科研发展的评价指标体系，帮助高校明确科研的方向及指导具体科研活动，为推动高校科研工作的发展及高校科研成果评价提供了新的思路。