IBV 793/B株N基因的序列分析及地高辛标记探针、双重RT-PCR检测方法的建立与应用

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lastkaixin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
鸡传染性支气管炎(Infectious Bronchitis,IB)是由传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)引起的一种急性、高度接触性传染病。自30年代在美国爆发以来,现已成为世界各地流行的重要禽病。IBV是单股RNA病毒,该病毒基因可因点突变和重组而发生变异,故传染性支气管炎病毒血清型较多。已知的血清型有以侵害呼吸道为主的Conn、Iowa97、JMK、Florida、Arkansas99等和以侵害肾脏为主的M41、Holte、Gray、Australia“T”等30余种。Gough等(Gough et al,1992)报道了英国一种新的793/B血清型的IBV,该毒株和其它血清型传支毒株之间无交叉血清学关系;其免疫原基因S1的序列与欧洲17个传支毒株之间差异高达21~25%。2003年刁有祥、杨杰华等从山东省某蛋鸡饲养场产蛋异常下降鸡群中分离到一株793/B传染性支气管炎毒株,命名为TA03株。目前,该血清型IBV在西班牙、德国、荷兰、中国、意大利、泰国等国均有发生和流行,对养鸡业危害较大。根据GenBank中已经发表的IBV N基因的保守序列,设计合成一对引物,利用RT-PCR技术扩增IBV N基因的582 bp的核酸片段,并制备出地高辛标记的IBV核酸探针。特异性检测结果表明,该探针能与不同毒株的IBV核酸发生特异性杂交,而与对照的NDV、鹅副粘病毒的核酸杂交反应为阴性;敏感性检测结果表明,该探针对IBV的最低检出量为10 pg,显示所制备的核酸探针用于IBV的检测是可行的。参照GenBank已经发表的793/B和多株IBV的N基因和S1基因,设计两对引物,对样品的核酸模板进行扩增,建立了一种能够同时检测鸡传染性支气管炎病毒和鉴定出793/B血清型的双重RT-PCR方法。该方法对793/B血清型可检测到582bp和891bp两条核酸片断,其他的血清型只出现582bp一条核酸片断,而新城疫病毒、传染性喉气管炎、鹅副粘病毒菌未检测到特异型条带。该方法简化了聚合酶链式反应程序和缩短了检测时间。根据Genbank已经发表的传染性支气管炎病毒(IBV)N全基因组序列设计引物,对IBV 793/B分离毒株N基因进行克隆与序列分析。结果表明,IBV 793/B的N基因由1229bp组成,与Genbank已发表的11株IBV的N基因相比较,IBV 793/B的N基因共有88处点突变,在第991位发生了一个核苷酸的缺失。N基因的核苷酸同源性为86.9~91.4%,氨基酸同源性为75.8~77.5%。表明IBV 93/B的N基因存在着较大的变异性。
其他文献
一、提出问题,激发探究意识    问题是数学的心脏,有了问题,思维才有方向;有了问题,思维才有动力。作为教师应张开自己的耳朵倾听儿童关注和感兴趣的问题。如在教学 “百分数的意义”时,教师出示课题并问问学生:“你们想知道些什么?”此时学生们就纷纷提出自己感兴趣的问题,如什么是百分数?百分数有什么特点?有什么好处?它与分数有什么关系?……此外教师还应根据具体教学内容和倾听学生心声来创设好问题的情境,认
历史作为一科综合性强,知识点繁碎的学科,教师在教学过程中往往采取传统教学模式即提倡死记硬背,枯燥呆板的历史教学模式导致学生对于历史学科的学习缺乏学习积极性,严重消减
对于语文课程教学来说,作为小学课程中的基础,更是应该要受到格外的关注和重视.因此,在这样的背景环境条件下,我国提出了学科核心素养这样概念,希望通过在实际的课程中,对学
端粒酶(Telomerase)是真核细胞中的一种核糖核蛋白复合体,由端粒酶RNA组分(Telomerase RNA,TR)和端粒酶催化亚基(Telomerase Reverse Transcriptase,TERT)组成,是一种特殊的DNA聚
目前,我国正在进行新课程教学改革,生物学科作为高中理科类中重要的学科之一,对高中生物学科进行教学改革受到了社会广大人士的重视.对此,结合多年高中生物教学经历,以及近年
高考改革方案的推进与深入,让我国教育事业焕发出了新的生机和光彩.在新时代这个大背景之下,社会文明的进步和发展需要综合素质全面发展的更多人才.而历史,作为高中教学之中
随着社会的发展和课程改革的推进,学校和教师越来越关注学生综合能力的发展和提高.并且,新课标明确提出:教师除了要在教学中提高学生的数学知识水平,还要注重学生数学思维的
在大数据背景下,数学教学方式在不断的优化,学生获取知识与信息的方式变得更加的丰富多样,知识更新的速度在加快.信息化时代学生与传统教育中的学生不同,接受知识的能力更强,
《小学语文课程标准》中指出:“口语交际能力是现代公民的必备能力。应在具体的口语交际情境中,培养学生倾听、表达和应对的能力,初步学会文明地进行人际沟通和社会交往,发展合作精神。”因此,我们教师在语文课堂教学中,要充分利用教材、拓展教材,注重学生口语能力的训练,逐步使学生具有文明和谐地进行人际交流的素养。    1.情境交流法    口语交际是在特定的环境里产生的言语活动。这种言语交际活动离开了“特定
写作是语文教学的重要部分,是语文的“半壁江山”,但长期以来,很多学生都怕写作文,一听到写作文就喊头痛,有的说没东西可写,有的说不懂怎样写,有的说达不到要求的字数,总之提不起写作的兴趣。究其原因,主要在于平常积累的素材少,作文的方法没掌握好,训练不得法等。我认为在语文教学活动中,教师如何激发学生的写作兴趣,是学生提高写作能力的关键。于是,近几年来本人在教学中作了一些激发学生写作兴趣的尝试,收到较好的