随着我国社会经济的高速发展,水环境污染和水生态系统失衡问题已经严重限制了我国经济的可持续性。如何科学合理的规划、管理与维持现有的生态系统服务功能；加强对生态系统受严重破坏区域治理恢复力度；追求人与环境相和谐的经济发展模式都是目前急需思考和解决的问题。而河流水生态系统健康评价作为一种河流管理的评估工具和技术手段，具有分析河流生态系统受干扰状况及确定不同河流区段的环境管理、生态修复目标的作用，对河流的治理和恢复有着重要的意义，因此逐渐成为研究热点。本文在总结分析国内外有关河流生态系统健康和生态系统服务功能研究成果的基础上，结合辽宁省辽河流域水生态功能分区结果，针对清河、汎河社会经济发展模式与污染特征，开展了以下研究：（1）查阅相关研究文献资料，对河流水生态健康概念的提出与发展进行了介绍，对定义内涵进行了总结与对比，揭示不同定义之间的主要分歧所在。对河流生态系统健康评价主要方法及在国内外的评价实践进行阐述，并总结了目前该领域发展存在的问题。（2）对辽宁省辽河流域水生态功能三级分区内容、方法过程以及成果进行了介绍，确立以清河、汎河11个水生态功能三级区为基本评价单元，并对各评价区块的区域水生态特征进行概括。（3）对水生态服务功能的定义内涵、分类以及评价方法进行研究和总结，结合水生态系统健康的内涵探讨了二者的关系，即二者是相互影响、相互制约、相辅相成的。并以清河汎河水生态功能三级区为基本评价单元，构建清河汎河水生态系统服务功能评价指标体系，采用改进层次分析法对两个小流域11个评价单元水生态系统服务功能重要性进行评价，识别主导服务功能。（4）在对各评价单元的主导服务功能和主要利用方式的识别和调查基础上，采用模糊综合法结合改进层次分析法构建了清河、汎河水生态系统健康评价模型，以实地采样以及相关统计资料为主要数据来源，建立以物理结构状况、水质状况、水生生物状况、人类干扰状况、恢复状况五项内容为准则层，及19项因子组成的指标层的评价指标体系。结果显示清河有1个处于“健康”状态（IV-5-11），2个出于“亚健康”状态（IV-5-10、IV-5-12），2个处于“一般”状态（IV-5-9、IV-5-13），2个处于“疾病”状态（IV-5-8、IV-5-14）。汎河流域4个水生态功能三级分区中，有3个处于“健康”状态（IV-5-2、IV-5-3、IV-5-4），1个处于“一般”状态（IV-5-1）。汎河整体健康状况明显优于清河。