自1978年经济体制改革以来,因为社会利益分配结构和权力结构发生了巨大的变化,我国的行政腐败问题在发生的范围和面积上增幅巨大。行政腐败相对容易被人们所发现和关注。微腐败相对于行政腐败而言,其本身处于“廉”与“非廉”之间的模糊地带,存在复杂繁多的表现形式,比较不容易被发现,但其社会影响却是极坏的。习近平总书记对于微腐败问题多次作出重要批示,必须坚持抓早抓小,对于有病的领导干部要马上惩治,发现问题必须及时处理,不能养痈遗患。学术界对微腐败问题的研究程度仍也在不断地提升,但是对于微腐败治理困境的研究相对较少。本文遵循“发现问题、分析问题、解决问题”的基本思路,结合近年来在镇江市R区纪检监察机关办理微腐败案件的工作实践,参考国内外文献研究,从界定微腐败的概念入手,分析了微腐败的特点、成因及危害性,对制度预防腐败理论进行相关解释。并在此基础上通过对镇江市R区微腐败案例研究,找出存在的问题,提出对策建议,旨在为进一步治理微腐败提供依据。通过深入分析镇江市R区微腐败治理工作的现状和案例研究,发现镇江市R区微腐败治理困境如下:受到“非廉”心理人群排挤;对微腐败行为界定模糊;微腐败预防机制失灵;微腐败惩治效果不好;治理模式与微腐败主体间的矛盾等。分析上述问题产生的原因,主要有:防治微腐败教育制度缺少系统性;界定及预防微腐败的相关机制不完善;微腐败治理尺度不明确;现有微腐败惩治制度不完备;微腐败治理合力亟需增强等。针对微腐败治理存在的问题,结合制度预防腐败理论,提出以下对策:通过构建基层廉政教育文化体系、对基层工作人员廉洁自律教育制度系统化和净化基层政治生态环境来完善防治微腐败的教育制度;推进基层政务公开、规范基层政府资金管理制度、完善基层监督机制来健全预防微腐败的制度;织密制度的笼子、加大惩戒的力度、整合反腐力量等方式优化对微腐败的惩治制度。