葡萄和杨树基因组中NBS类型抗病基因的研究

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NBS-LRR类型基因是植物中主要类型的抗病基因,且抗病性是这类基因的所发现的唯一功能。目前对抗病基因的研究主要集中于草本植物,对木本植物的NBS-LRR类型基因的进化模式知之甚少。本研究分别调查了葡萄和杨树中459个和330个NBS-LRR编码的基因,系统分析了它们的基序组成,系统进化关系及物理定位。研究发现,与一年生植物水稻和拟南芥相比,在多年生木本植物基因组中,NBS类型基因中发生了较多的新近的基因重复(duplication)。因此,其NBS类型基因的旁系同源序列(paralogs)之间的同源性较高,并且很大比例的这类基因聚集在众多基因簇(gene clusters)中。这些结果表明,新近的串联基因重复在多年生植物NBS类型基因的扩张中占主导地位。这一进化机制与本研究中所揭示的高概率基因重组一起,使多年生植物能够快速地进化出新的抗性,以弥补世代周期长对其遗传变异所带来的影响。另外,研究还发现,在TIR-NBS类基因中存在着广泛的物种特异性的基因扩张。然而,在non-TIR-NBS类基因的进化树中,多数分枝表现为物种间的一一对应性,即存在明显的直系同源关系,且基因扩张相对较少,这表明TIR-NBS与non-TIR-NBS类基因二者之间的进化模式存在较大的差异。
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