基于CRISPR/Cas12a技术便携式检测新型布尼亚病毒方法的建立及方法学评价

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dfvg454545g
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)是2010年中国疾病预防控制中心分离并确认的一种新病毒。人类感染SFTSV会引起发热伴血小板减少综合征(SFTS),其主要临床表现是高热、血小板减少、白细胞减少、胃肠道症状和高病死率。多种病原体可导致“发热伴血小板减少”,很难根据临床症状将SFTS与其他具有类似症状的疾病进行区分,因此病原学诊断极为关键。目前,严重发热伴血小板减少综合征的病原学诊断主要依靠病毒分离、抗体检查和核酸检测。病毒分离实验周期长,细胞病变不明显,不适用于临床快速诊断;免疫学检测方法更便宜和方便,但准确性、灵敏度以及检测窗口期较长仍然限制了其在快速诊断中的进一步应用;而PCR,虽具有快速、灵敏度高的特点,但对器材和操作技术要求高,不适用于便携式检测。由于SFTSV主要由蜱叮咬传播,且病例主要出现在医疗条件较差的山林地区。医疗条件的匮乏加上缺乏早期快速便捷的检测手段,这些山林地区的患者常因延迟确诊而导致病情恶化而死亡。因此,为满足快速和便捷的诊断需求,我们开发了一种将CRISPR/Cas12a技术与免疫层析试纸相结合的快速诊断方法。该方法具有很大的现场诊断潜力,可能对SFTSV控制做出重要贡献。方法本研究中,我们将逆转录-环介导等温扩增(RT-LAMP)与CRISPR/Cas12a相结合,建立了一种快速、灵敏、成本低和适用性强的检测方法,该方法运用RTLAMP扩增新型布尼亚病毒核酸,再通过CRISPR/Cas12a平行切割靶序列和ss DNA报告基因,使用免疫层析试纸条捕获标记有FAM荧光素和生物素的ss DNA探针,最终在试纸条上显示出肉眼可见的信号。可在2h内实现新型布尼亚病毒的核酸检测,且不依赖于大型实验室里的贵重仪器,可应用于各类场所,实现便携式检测。结果该方法被证实对SFTSV具有高度特异性,并且与其他RNA病毒未发现交叉反应。将其应用于40份临床血清样本中新布尼亚病毒的核酸检测,以RT-PCR为诊断金标准,该方法具有100%的灵敏度和94.7%的特异度,其最低检测限可达25copies/μL,两者的检测一致率为97.5%。结论本研究基于CRISPR/Cas12a系统建立了一种新型核酸检测方法,并研发了新布尼亚病毒快速检测试剂盒,可在2小时内完成检测,肉眼即可观察结果。可在现场即时检测及资源有限的医疗环境下,为SFTSV核酸检测提供一个有吸引力的选择,有望应用于SFTSV的即时检测及流行病学调查等领域。
其他文献
现在国内工程界提高发电效率,抑制燃料棒振动的方法是使用格架,这种格架一方面可以起到支撑固定燃料棒的作用,又可以搅混均匀来流,实现更好的换热效果。但同时,使用这种格架固定的反应堆体积很大,不利于核电装置小型化的发展。当轴向流动的冷却液流经绕线燃料棒时,会导致在燃料棒上产生横向的随机振动,并且经研究发现这种振动的幅度取决于绕线的参数,如绕线的直径和绕线的圈数,以及燃料棒之间的间距。过于剧烈的振动将会导
学位
目的观察铁冬青酸(RA)对人肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,并初步探讨其机制。方法以人肺腺癌A549和PC9细胞作为研究对象,实验分为对照组和实验组。其中,对照组包括空白对照组、溶剂对照组(含0.1%DMSO)和细胞对照组(无铁冬青酸,无DMSO),实验组则按照铁冬青酸的浓度20、40、60、80μmol/L分为四组。选取位于对数生长期的细胞,用不同浓度的铁冬青酸处理24小时后,行下列实验:
学位
目的本实验旨在探究不同浓度的聚二甲基硅氧烷/葡萄糖酸氯己定(polydimethylsiloxane/chlorhexidine gluconate,PDMS/CHG)涂层对钛表面生物相容性的影响,为将来用此抗菌涂层预防和治疗种植体周围疾病提供科学依据。方法将用砂纸打磨至7000目的钛试件随机分为五组,一组不做处理为空白对照组,标记为Ti组,其余四组为实验组,依次为PDMS组(仅用PDMS处理)、
学位
目的通过文献回顾法、焦点小组访谈法、德尔菲法,编制“成人外周静脉留置针导管失效风险评估表”,探讨成人外周静脉留置针导管失效的风险因素,建立成人外周静脉留置针导管失效的列线图预测模型。方法第一阶段:参考相关指南和文献形成成人外周静脉留置针导管失效评估表草案。采取目的抽样的方法,选取12名临床护理专家进行焦点小组访谈,进一步扩充框架的内容,并形成评估表的初始版本。邀请安徽省28名专家进行两轮专家函询,
学位
目的与背景糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)是糖尿病最常见的微血管并发症。DN是以血糖升高的血流动力学和代谢变化为经典的特征,但是巨噬细胞介导的慢性炎症在DN病理发展过程中被普遍认为是一个重要事件。因此任何抑制巨噬细胞免疫炎症的方式都将给DN的治疗带来希望,探究具体炎症作用靶点及筛选防治药物都具有重要的临床意义。巨噬细胞具有表型可塑性强的特点,M1型巨噬细胞主要分泌细胞因
学位
推荐系统是用于解决当前随着大数据的发展而日益突出的信息过载问题的重要手段,为用户筛选所需信息节省了大量时间和精力,同时也创造了巨大的商业价值。最近几年,由于能够有效缓解传统推荐系统中存在的交互稀疏问题和冷启动问题,引入了知识图谱的推荐系统正受到越来越多的研究者关注。基于知识图谱的推荐系统的主要挑战是从用户历史交互信息和知识图谱所包含的丰富的额外信息中学习高效的用户/物品嵌入。然而,现有的大多数方法
学位
目的观察不同浓度苯噻啶(Pizotifen)对人肺腺癌A549和PC9细胞的增殖、迁移与侵袭能力的影响,并初步探究其机制。方法传代培养人肺腺癌A549和PC9细胞,取对数生长期的细胞,将其分为对照组(细胞对照组为培养基直接作用于细胞、溶剂对照组为含有0.1%二甲基亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)的培养基作用于细胞)和实验组(浓度为10、20、30、40μmol/L的苯噻啶作用
学位
本文所探究的主要课题为智能交通中的交通速度预测任务,而城市交通速度预测是智能交通系统中一个基本而必不可少的任务。及时和可靠的交通速度预测对于减轻道路交通压力、协调交通管理和建设智能城市交通发挥着举足轻重的作用。交通速度预测任务旨在预测未来一段时间内沿城市道路边缘部署的所有交通传感器记录的交通速度信息。由于静态的路网结构和动态的路况变化,交通数据本质上呈现时空特性。传统的交通速度预测算法通常为基于统
学位
目的:深度学习图像重建(Deep learning image reconstruction,DLIR)是一种新的图像重建技术,本研究通过临床病例来探讨DLIR技术在胸部低剂量CT中的应用价值和优势。资料与方法:收集自2021年1月-2021年3月在安徽医科大学第一附属医院行胸部CT扫描检查的患者48人,其中女性30名、男性18名,平均年龄±标准差,49.8±14.3岁。记录患者性别、年龄、身高(
学位
目的脑白质损伤(white matter injury,WMI)是早产儿在婴幼儿期常见的损伤类型,是全球性的健康问题,也是导致大脑性瘫痪和认知缺陷最常见的原因。本研究通过发育早期脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)重复刺激,建立Sprague-Dawley(SD)大鼠WMI模型,探讨炎症反应介导下的“多重打击”对其组织学、行为学的影响及相关的分子机制。方法根据随机数表法,将32只
学位