基于深度学习的无监督生物医学图像复原

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生物医学图像在采集的过程中极易被噪声或伪影污染,从而影响图像质量,甚至可能影响医生对疾病的正确诊断。生物医学图像复原是图像处理领域的一个重要研究内容,包括医学图像去噪、伪影去除、图像重建等任务,在实际生物医学成像中具有很高的应用价值。本文主要涉及三种生物医学图像,包括血管内超声图像,电子计算机断层扫描(CT)图像以及荧光显微图像,其中,血管内超声图像和CT图像属于医学成像,荧光显微图像属于生物学图像。每种生物医学图像有着不同的退化模型(伪影和噪声原理),对于血管内超声图像来说,导丝伪影是一种常见的图像退化模型,是由成像系统中的金属导丝遮挡超声波产生。对于CT图像来说,低剂量CT图像被用于在减少病人辐射伤害,由于辐射剂量的减少,引起在图像采集过程中的量子噪声,这种量子噪声呈现泊松分布。而针对荧光显微图像,其噪声分布为泊松-高斯噪声。本文涉及的生物医学图像复原任务包括血管内超声导丝伪影去除、低剂量CT图像及荧光显微图像去噪。随着深度学习技术的快速发展,基于卷积神经网络的模型成为了目前生物医学图像复原的主流方法,这些深度学习模型的训练需要两个重要条件:(1)庞大的数据量;(2)有噪数据必须有其对应的无噪数据,才能计算损失函数。这种有监督深度学习模型很难应用到实际的生物医学环境中,这是因为:(1)成对的有噪声和无噪声生物医学图像很难获取;(2)生物医学图像获取成本较高;(3)生物医学图像的数据量一般较小。为了解决当前深度学习算法不足,本文提出两种无监督深度学习算法,分别应用于血管内超声导丝伪影去除、低剂量CT图像及荧光显微图像去噪任务。针对血管内超声去除伪影任务,本文开发了一种无监督深度学习方法,基于图像转换网络CcyleGAN,结合注意力机制,促使网络只关注于伪影区域,保持正常成像区域不变,这种方法不需要有伪影-无伪影的成对数据就可以进行训练和测试。其主要创新点是:(1)提出了利用注意力机制使模型在训练中只关注导丝伪影区域,而保持其他正常成像区域不变;(2)利用帧间相关性来提升伪影去除效果。针对低剂量CT图像和显微图像去噪,本文提出了一种可以利用像素之间自然相关性的方法,这种方法属于自监督学习方法,可以实现只利用有噪图像即可实现训练。这种方法只需要有噪声图像即可训练,同时,这种方法可以在单个图像上进行训练和测试,无需构建训练集,克服了上述有监督深度学习方法的不足,在生物医学图像去噪方面具有很高的实际应用价值。
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