基于高通量测序和生物信息学挖掘Galectin-9在胶质瘤中的分子和临床特点

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dfl_peng
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的:胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)是颅内最常见的原发性恶性肿瘤。半乳凝素9(galectin-9)是半乳凝素家族的重要成员,在淋巴细胞和其他一些细胞类型中表达。许多研究表明,半乳糖凝集素不仅参与许多生理过程,例如大脑发育、血管生成、T细胞稳态和胎儿-母体耐受性,而且还参与肿瘤进展、免疫逃逸和肿瘤血管生成。同时,越来越多的证据表明,galectin-9可以作为某些恶性肿瘤的潜在预后生物标志物和有希望的治疗靶点。但是,由于在胶质瘤,特别是GBM中galectin-9的具体作用机制仍不清楚,深入研究galectin-9的抗肿瘤生物学过程将为靶向galectin-9治疗提供分子基础。本研究拟探讨galectin-9分子在正常脑组织和胶质瘤患者、不同病理级别胶质瘤、不同分子亚型GBM中的表达特点及其galectin-9介导恶性进展具体作用机制的研究。本研究将为galectin-9靶向及综合治疗提供更有效的策略。研究方法:通过GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)可视化网站,我们对人类正常组织和各种对应肿瘤组织中的galectin-9表达进行分析,接下来进一步分析研究TCGA和CGGA数据库里胶质瘤不同病理级别、GBM不同分子亚型中galectin-9的表达。其次,我们利用免疫组化实验分析了天津医科大学总医院神经外科的2例癫痫患者脑组织作为对照和50例不同级别神经胶质瘤患者样本中galectin-9的表达特点、以及GBM肿瘤中心及肿瘤边界分布特征及预后。最后,为了进一步确定galectin-9在肿瘤进展中的具体作用机制,我们同时利用TCGA和CGGA数据库进行了生物信息学分析;由于分析结果提示了galectin-9与免疫反应密切相关,因此为了进一步确定galectin-9参与的具体免疫反应机制,我们选择了7不同免疫功能相关基因集分别代表不同免疫功能;最后,通过聚类分析和相关分析分析galectin-9与不同免疫细胞亚群之间的相关性。研究结果:与对照脑组织及低级别胶质瘤相比,galectin-9在胶质瘤患者中高表达,且级别越高表达越高,在GBM患者中表达最高。同时galectin-9在间质型胶质母细胞瘤中高表达,并且高表达galectin-9的胶质瘤患者的生存期明显低于低表达galectin-9的患者;组织芯片数据(TMA)显示:galectin-9在肿瘤核心部位的表达高于肿瘤边界,并且高表达galectin-9的胶质瘤患者预后更差。生物信息学结果表明:galectin-9与胶质瘤免疫反应密切相关,进一步分析发现,galectin-9与免疫检查点分子和M2肿瘤相关的巨噬细胞介导的免疫抑制微环境密切相关。结论:与对照脑组织及低级别胶质瘤相比,galectin-9在胶质母细胞瘤中高表达,尤其是在间质型GBM中表达更高,同样,在肿瘤核心区域表达明显高于肿瘤边界;深入分析发现:galectin-9与免疫检查点分子和M2肿瘤相关的巨噬细胞密切相关,那么,以上这些结果更加支持galectin-9可能通过M2肿瘤相关的巨噬细胞发挥肿瘤免疫抑制或免疫逃逸的作用,因此galectin-9免疫抑制性微环境中发挥重要作用,对galectin-9的靶向治疗可能与当前的免疫疗法具有协同作用提供重要依据。
其他文献
随着军事科技的快速发展,军事目标的电磁散射特性分析、设计、识别变得尤为重要。积分方程作为电磁场中计算结果精度较高的一种数值方法,在计算电磁散射方面得到了广泛的发展
近年来,随着经济的发展全球石油和化石燃料的消耗逐年上升,随之而来的环境问题引起人们关注,寻找可替代当前介质能源和发展和绿色环境友好型经济方式已经迫在眉睫,化学电源由于其自身的优点在能源领域引发科学工作者和企业的兴趣,锂离子电池作为一种二次电池具有很多优点。例如:电压高、比能量大、长循环寿命、成本低等优点成为研究热点,开发出更高性能的锂离子电池成为主要任务,锂离子电池是由正极活性物质、负极活性物质、
随着互联网技术的普及,网络书店在日常生活中越来越普遍,凭借着方便快捷的服务、低廉的价格,京东商城、亚马逊、当当网、天猫商城等网络平台走进了越来越多的消费者生活中,对实体书店的发展造成了极大的冲击,可以说,渠道的争夺已经关系到企业的销量和发展,渠道直接决定着销量,对于S民营书店(下文简称S书店)来说,渠道管理的好坏,渠道策略的优良更是发展的关键所在。本文以S书店作为研究对象,做了如下工作:第一,结合
随着移动终端普及和互联网技术的快速发展,使得信息业务数据量呈现几何级数的爆炸性增长,从而进一步加剧了“信息过载”的问题,已成为互联网技术继续发展的严重阻碍。现有基
环境声音分类和声纹辨识均属于音频信息处理范畴。环境声音分类是应用信号处理、计算机及人工智能等技术对特定环境声音信号进行分析处理并实现对声音信号自动分类辨识,被智能家居、场景分析和智能监控等领域广泛应用;声纹辨识就是从已知的声纹集合中找出与特定音频声纹相匹配的那个人,广泛应用于刑事侦探、智能监控、金融安全等领域。随着人工智能技术的发展,环境声音分类和声纹辨识越来越受到业界研究者的关注。早期的环境声音
随着医药学的发展,药物混合试验越来越受到重视.药物混合因其多靶向性能削弱抗药性;药物之间的协同作用能有效地减少单个药物的剂量,从而能有效地削弱药物的毒性.因此,在特殊
反应扩散方程反映了相关变量与时间、空间之间的关系,它在生态学领域有许多的应用.为了更好地认识生态学中的自然现象,人们通过建立反应扩散方程来研究生态学中种群间的变化
命题逻辑系统在非经典数理逻辑中起着重要的作用,模糊逻辑命题系统MTL是在BL命题逻辑系统的基础上推广的更为广泛的重要系统,本文在基本命题逻辑系统MTL中对其不同的方面进行
连续管目前已大量应用于钻采作业中,其节约成本、作业安全可靠等诸多优势使得它一直深受各国研究者的关注。连续管滚筒是起下、储存和运输连续管的重要装置,其容量、体积和结
GaN基LED具有节能、可靠性高及寿命长等优点,可用于照明、显示以及通信等领域。目前,窄的调制带宽和大电流下内量子效率下降已成为制约GaN基LED进一步发展的瓶颈。随着纳米技