油桐属(Vernicia Lour.)植物是重要的工业油料植物,由于种子油脂主要成分为桐油酸,是一种优良的干性油,主要应用于工业上油漆、清漆的生产和化工合成。近年来,研究发现桐油也是一种良好的生物柴油的原料,利用油桐属种子油脂作原料生产生物柴油逐渐受到中国和南亚一些国家的关注。油桐属在中国有两种：油桐(Vernicia fordii)和木油桐(Vernicia montana),均分布于中国南部和东南亚一些国家,它们亲缘关系很近,却在形态上有很多差异。虽然油桐的种植和利用已有数百年的历史,但木油桐的种植和利用还相当有限。根据我们目前的研究和初步评估发现,木油桐比油桐有更高的桐油产量,另外,木油桐一直被认为有着更强的抗逆境能力和抗病能力。目前在越南、老挝、缅甸和泰国,木油桐已在一些丘陵地区大面积种植并建立了相应的加工厂。因此,木油桐较之油桐更适合作为生物柴油的原料。本研究广泛收集了30份不同地理种源的木油桐种质资源和3份油桐种质资源。分别利用分子生物学和生物信息学技术,从油桐的EST库中开发了22个EST-SSR分子标记,用磁珠富集法从木油桐基因组中开发了20个Genome-SSR分子标记。利用42个SSR分子标记分析木油桐种质资源的遗传多样性。结果显示木油桐种质资源具有中等程度的遗传多样性(He=0.553,PIC=0.490)。种质亲源关系遗传分析显示木油桐种质资源具有明显的遗传分化(Fst=0.327, p<0.01),且与其谱系地理密切相关。本研究开发的SSR分子标记不仅为调查油桐属植物的居群遗传多样性和种质鉴定提供重要的技术手段,同时为油桐属植物的分子辅助育种提供分子标记,有利于促进油桐属植物资源的品种选育与种质开发、利用。