重庆市猪链球菌流行病学调查及GDH基因的克隆和序列分析

来源 :西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yanlj007
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
1猪链球菌1、2、7和9型的二重PCR方法的建立以猪链球菌特异性的谷氨酸脱氢酶基因(gdh)及猪链球菌型特异性的荚膜多糖合成相关的基因(cps1J,cps2J,cps7H,cps9G)为目的基因,设计合成五对引物,分别扩增1型的gdh和cps1J,2型的gdh和cps2J,7型的gdh和cps7H,9型的gdh和cps9G,建立了猪链球菌1、2、7和9型的二重PCR方法,并用猪链球菌所有35个血清型的参考菌及1株B群链球菌和1株C群链球菌验证了1、2、7和9型二重PCR方法的特异性。对1、2、7和9型二重PCR扩增产物进行克隆并序列分析表明,其扩增产物为特异性的目的基因片段;用菌落计数法对二重PCR进行了敏感性试验,结果1、2、7和9型的二重PCR都在100cfu时仍能扩增出目的基因片段;12株已知的2型菌用2型的二重PCR方法进行了检测,其检测符合率为100%;10株疑似的猪链球菌用1、2、7和9型的二重PCR进行了检测,结果发现其中的2株菌为7型猪链球菌,2株菌为9型猪链球菌;同时,在长达一年的时间内定期进行了1、2、7和9型二重PCR试验,结果表明,1、2、7和9型的二重PCR具有很好的稳定性。2用1、2、7和9型的二重PCR方法对重庆地区猪链球菌进行检测和鉴定在重庆市的20个区县随机采取了1360份健康猪的扁桃体和116份病猪组织,结合血清学方法等方法,用所建立的猪链球菌1、2、7和9型的二重PCR方法对其进行了猪链球菌的检测。从1360份健康猪扁桃体中检测鉴定出猪链球菌224株,其检出率达到16.5%。224株猪链球菌中,2型菌有5株,分别来自3个区县;7型菌有4株,分别来自4个区县;9型菌有4株,分别来自2个区县;未能检测到1型猪链球菌:210株菌未能进行定型。而从116份病猪组织中检测鉴定出了8株猪链球菌,分别来自4个区县,但不是1、2、7和9型猪链球菌。本次试验中,检测到1株1/2型猪链球菌,为我国首次报道。3猪链球菌2、7和9型重庆分离株毒力因子mrp和epf的检测和其中的一些新发现溶菌酶释放蛋白(MRP,mrp)、胞外因子(EF,epf)被认为是猪链球菌中两个至关重要的毒力因子,这两种毒力因子有时也表现为MRP~*(大分子量MRP,mrp~*)、MRP~s(小分子量MRP,mrp~s)、EF~*(大分子量的EF,epf~*),而不同分子量的MRP和EF也与菌株的毒力或致病性的不同有较强的相关性。对包括重庆分离株在内的共26株猪链球菌2型菌(25株从猪上分离,1株从人上分离)进行了毒力因子mrp和epf的检测,结果发现大部分分离自发病猪(包括病人)上的2型菌株均为mrp~+epf~+,只有菌株SH0401为mrp~+epf~*,而大部分从健康猪扁桃体分离的2型菌为mrp~-epf~+(即表现为缺失毒力因子mrp),只有菌株CQTN63为mrp~+epf~+,另外,2型参考菌株735为mrp~-epf~*。对其中10株菌的epf进行了克隆并序列分析,发现它们的核苷酸同源性都在99%以上。对菌株SH0401和735的epf~*进行了克隆,其序列与GenBank公布的菌株1890的序列相一致。对包括重庆分离株在内的共15株2型以外(包括1、1/2、7、9型)的菌株进行了毒力因子mrp的检测,结果首次发现三株7型菌(CQBB214、CQWZ10、8074)和一株1/2型菌(CQFL42)均能扩增出474bp的基因片段,这一结果在国内外均未见相关报道。对扩增出的474bp基因片段克隆并序列分析发现,其序列中的465bp与2型菌的mrp(1148bp)几乎是一致(同源性达到了99%以上),但2型菌却比其多出了670bp的一段序列。另外,还发现一株7型菌BJ09为mrp~*(2000bp左右),对其序列分析表明,其序列中的800bp与2型菌的mrp几乎一致(同源性达到了98%以上),但其800bp以后的序列则与2型菌的mrp序列完全不同。同时还对这15株菌进行了毒力因子epf的检测,结果没有检出epf。4猪链球菌谷氨酸脱氢酶(GDH)基因的克隆和序列分析有研究表明,猪链球菌谷氨酸脱氢酶(GDH)既是一种保护性抗原,又能作为一种诊断性抗原,且与其它蛋白相比,GDH有很低的点突变率和高度保守等优点。因此,GDH有着越来越广阔的应用前景。本试验对44株各型(包括1、2、1/2、7、9、4、19、27、30、31型和1株未知型)猪链球菌的谷氨酸脱氢酶基因(gdh)开放阅读框(1347bp)进行了克隆并序列分析,结果发现,所有的2型菌的gdh的同源性都在99%以上,而各型之间的同源性大多也能达到94%以上。同时还发现2型以外其他型猪链球菌的gdh在162、279、534、898、916、978、981、991、1011、1023、1068、1077、1083、1098、1104、1107、1137、1158和1224位处的核苷酸发生了突变,表明这些位点上核苷酸的突变与猪链球菌血清型的改突变有明显的相关性,也说明这些位点是重要的突变位点。同时发现gdh的978~1023位点和1060~1120位点是其两个高变区域。44株菌的氨基酸序列的同源性都达到了97%以上,并具有GDH1型的典型保守序列。与2型相比,其他型的GDH氨基酸序列在3个位点都发生了改变,分别是299位点(由S变为A)、305位点(由K变为E)、330位点(由K变为E),说明这几个位点上的氨基酸改变与血清型的改变有很大的相关性。
其他文献
前言金堆城木子沟尾矿库位于三十亩地选矿厂南面的西木子沟内,距二选厂约2公里。尾矿库汇水面积为5平方公里。原设计木子沟尾矿坝最终堆积标高为1210米,服务年限10年,到1983
在一个行业的成长初期,任何企业意欲占据一席之地,跑马圈地都是必由之路,电商也难以例外。要和传统零售业一争高下,快速掠夺传统零售业的市场份额,在跑马圈地中快速崛起,价格利器不但直接而且有效。  为什么电商在成长初期,就高举价格利器?这与传统零售业成长初期保有良好赢利能力大相径庭。不仅因为要直面挑战已经相对成熟的传统零售业,在传统零售业中抢得市场份额,而且以风险投资为成长动力之一的电商,快速长大是该成
应英国煤炭局(NCB)重点开发委员会(Major Development Committee)的邀请,多斯科国外工程公司(Dosco OverseaEngineering)开始了一项备有高压水射流辅助切割装置(HPWAC)的悬
词汇是语言的建筑砌块,离开词汇,语言就没有什么实际意义。Wilkins就坦言道:“没有语法,很多东西无法传递;没有词汇,则任何东西都无法传递。”词汇教学在整个大学英语教学中日益成为一个不可缺少的重要组成部分。然而,由于受传统的结构主义语言学的影响,很多教师在词汇教学中比较注重词汇结构和形式,只停留在对词的概念意义的解释上,而往往忽略了词的关联意义,对词所应用的语境讲解偏少。同时词汇教学方法比较单一
本文通过对荣华二采区10
期刊
口蹄疫(foot-and-mouth disease,FMD)是一种由口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)引起的,具有高度传染性的,能在牛、猪、羊等偶蹄类动物中广泛传播的疾病。其临
摘要: 英语口语一直是使中国英语教学者和学习者都比较头疼的事情。由于缺乏良好的英语口语学习和实际操练环境,很多英语学习者只能够从听力、阅读、写作和书面翻译上有进一步发展,而口语却一直是他们最难胜过的拦路虎。《心理语言学》中关于言语生成的理论将人类言语的生成过程进行解析,使得原本复杂、奥秘的言语生成变得清晰、可以理解。将这一理论应用到日常的英语口语教学中,将会帮助学生建立学习英语口语的自信心,使他们
摘要: 英文正式信函包括英文公函和商业信函,信函中信头和信内地址提供了发信人和收信人的详细信息,是信函的重要组成部分。本文通过举例,详细介绍了信头和信内地址使用的格式与语言,以便涉外活动人员能够准确地使用英文信函,促进工作。  关键词: 正式信函 英文公函 商业信函 信头 信内地址    英文信函分为私人信函和正式信函两种,其中正式信函包括英文公函和商业信函。英文公函和商业信函是政府间或企业间、企
在中国基础教育中,班级体是十分显著的特色.学校的思想品德教育和教学工作的开展需要以班集体为基本单位,班主任的教育思想工作和教学管理工作直接影响着学生的长远成长和个
摘要: 在对话和交谈中,人们未必会直接地说出想要说的话,而有可能含蓄地表达自己的意思。这样往往会给学生理解话语的真正含义造成一定的障碍。本文通过介绍和分析格莱斯的会话含义理论及其在英语视听课中的实际运用,证明在英语视听课中运用会话含义理论进行教学的必要性。  关键词: 会话含义 合作原则 试听课程    本人在进行《英文影视欣赏》这门课程的教学过程中,发现有太多的例子如果单从文字所传达的字面含义去