鳗弧菌基因组测序及比较基因组学分析

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鳗弧菌属弧菌科,是全世界范围内海水养殖业中重要的鱼类致病菌,能感染鱼类患弧菌病。鉴于鳗弧菌对海水养殖业巨大危害,各国着重研究鳗弧菌毒力机制并开发相应疫苗预防弧菌病。本实验室从山东沿海感染弧菌病的鲈鱼上分离出鳗弧菌MVM425强毒株,通过基因缺失和质粒敲除构建了鳗弧菌减毒活疫苗株MVAV6203,经免疫效力评价表明该减毒活疫苗株具有良好的免疫保护率。本课题通过454、Illumina Solexa高通量测序及PCR法拼接,完成了鳗弧菌MVAV6203基因组测序。MVAV6203基因组含有两条染色体,基因组平均GC含量为44.5%,其中大染色体Chr1为3,097,087 bp基因组精细图,小染色体Chr2为2个super-contig组成的基因组草图,大小约950 kb,Chr1含有2838个基因,Chr2约含有1000个基因。基因组序列分析表明Chr1基因组中含有溶血素、鞭毛蛋白、外膜蛋白等毒力相关基因,温度、渗透压应激性和抗药性等环境适应性相关基因大多存在于Chr2。在鳗弧菌MVAV6203基因组Chr2中发现超级整合子结构,大小约为60 kb,含有50~80个基因盒,基因盒大多编码假定蛋白,部分基因盒携带博来霉素抗性基因和超级整合子稳定性相关的RelBE毒素-抗毒素系统编码基因。通过弧菌属比较基因组学发现,鳗弧菌MVAV6203与霍乱弧菌、创伤弧菌等弧菌进化距离很近,V.anguillarum毒力调控、致病机制及耐药性研究可能与其他弧菌相类似。比较基因组学分析还对一系列弧菌属中同源蛋白进行分类,获得1895个弧菌属同源蛋白。
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