高分子链在狭窄管道内构象和扩散的蒙特卡罗模拟

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大多数人在研究高分子受限在管道内的动力学时都将管道认定为平滑管道,即链-管道间相互作用在管道长度方向上不发生改变。而在实际的生物系统中,细胞膜、核膜等形成的通道常常会因为pH值的不同或者电荷的不均匀分布而形成相互作用比较复杂的管道。目前关于高分子在复杂管道内的构象性质和动力学行为的模拟研究比较有限,因此有必要研究高分子链在不同管道内的构象性质和扩散行为。  本文主要运用Monte Carlo方法模拟研究粗粒化珠簧链受限在狭长圆柱形管道内的热力学和动力学性质。体系主要考虑的相互作用有三种:高分子链内部的键连链节间相互作用与非键连链节间相互作用,高分子链与管道之间的相互作用。高分子链与管道的相互作用为Lennard-Jones势,我们考虑该相互作用与平行管道长度方向的位置无关的平滑管道,相互作用随位置周期性变化的周期管道和相互作用随管道位置梯度变化的梯度管道。本文首先模拟研究了链长N=32的高分子链在平滑管道内的构象性质,发现当链与管道的相互作用εpt=1.35时,高分子链发生脱附状态与吸附状态的转变,或者说εpt=1.35是链的临界吸附点。其次,考察了链-管道间相互作用强度、周期长度、管道尺寸对高分子链扩散的影响,结果表明高分子链在均匀平滑管道内扩散时,扩散系数近似与链-管道间相互作用强度以及管道半径无关;但高分子链在周期管道内扩散时,周期势的存在对高分子链扩散起明显的阻碍作用。最后,我们考察了梯度管道内高分子链的动力学,发现高分子链可以定向移动,但高分子链在含周期势的梯度管道内移动时,决定移位速度的物理机制可能不止一个。
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