交通运输业是国民经济发展的基础性行业,支撑着经济社会的和谐发展,但是事故频发、噪声和空气污染、气候变化等负面影响也在威胁着人们的生命安全,造成巨大的经济损失,产生外部成本。外部成本的存在,使得运输资源不能完全有效的提供给社会,制约着我国经济发展。因此,研究交通运输系统外部成本计算理论和方法,合理货币化评估运输产生的外部影响,对于提高运输资源的使用效率,建立环境友好型的运输结构,’促进运输与经济、环境的可持续发展具有重要意义。本文运用环境科学、经济学、灰色系统理论等学科的理论和方法,展开中国交通运输系统外部成本的计算理论和方法的研究,主要进行了以下工作：(1)根据外部性一般理论和交通运输系统的发展特点,明确了本文主要研究的外部成本包括交通事故、噪声污染、空气污染和气候变化四个部分。(2)针对各外部成本的主要影响因素在五种运输方式中的不同表现和危害,研究指出了各部分外部成本的主要评价指标。并根据评价指标对社会和个人的影响效果,分析选取了合理适宜的各外部成本货币化方法,为交通运输系统外部成本的计算建立了理论基础。(3)在外部成本计算理论的基础上,根据中国现有的统计资料,指出了中国交通运输系统各外部成本的计算方法。本文认为交通事故外部成本应按事故发生后造成的直接经济损失、人员伤亡损失以及社会服务机构损失三部分计算；在空气污染外部成本研究中,创造性地提出并计算了中国居民受污染影响的健康效应终端固定底线增量,并结合了疾病成本法、支付意愿法等多种方法构建了衡量整个社会的空气污染外部成本的方法体系。噪声污染和气候变化成本则分别采用成果借鉴法和避免成本法计算。(4)选取2005年为计算年份,应用论文中建立的各外部成本计算方法体系,计算了有实用价值的2005年中国交通运输系统总的外部成本和平均外部成本。