目的：以四川7种母草属植物的形态特征、微形态特征、细胞解剖学特征、药用有效单体成分的研究为基础,用现代科学的分析方法,探讨四川母草属植物的亲缘关系与药用化学组分的相关性,为利用种间关系寻找药用单体化学物质的资源植物及民族民间药物的质量控制标准的制定奠定良好的基础,并为进一步研究中国母草属植物的种间距离和系统演化提供参考。方法：通过本草考证及文献查阅、整理,确定四川母草属药用植物的种类、分布、药材别名与异名、化学成分及临床应用状况等。采用经典分类法、植物解剖学技术观察记录7种母草属植物的形态特征、花、叶微形态特征,叶、茎、果实横切面解剖学特征;选取21项指标进行数据测量,使用SPSS统计软件进行均值、标准差和变异系数分析,筛选出种内稳定、种间差异较大的指标,结合20项性状指标进行Q型聚类分析,拟得到较为合理的亲缘关系树形图。应用DNA条形码技术构建基于psb-A序列的NJ树。采用TLC技术定性分析母草属植物中可能含有的化学组分,HPLC技术定量分析母草药材及类似品中的齐墩果酸、绿原酸,并比较不同药材基源植物中的齐墩果酸、绿原酸的含量差异。结果：四川分布的7种母草属植物均有药用记载,其中母草Lindernia crustacea、泥花草L. Antipoda为民间较常用药物之一。基于微形态和细胞解剖学特征的聚类分析结果显示狭叶母草L. angustifolia和长蒴母草L. anagallis亲缘关系极近,在第一阶就聚到一起；宽叶母草L. nummularifolia与母草在第二阶聚为一类；陌上菜L. procumbens、泥花草聚在一起,与经典分类略有不同。基于psb-A序列的NJ树将狭叶母草和长蒴母草聚为一组,泥花草和旱田草L. ruellioides聚为一组,宽叶母草与母草未聚到一起,NJ树与经典形态分类结果一致。母草与泥花草药材以及类似品均含有共同的化学组分Beta-sitosterol和齐墩果酸。母草、狭叶母草、长蒴母草另含有绿原酸,而其他4种植物不含绿原酸。齐墩果酸和绿原酸的HPLC含量测定的线性回归方程分别为：Y=287367X-121845,r=0.9998；Y=959457X-156644,r=0.9999；线性范围分别为0.84-5.04μg；0.62～3.72μg,回收率分别为100.96%、99.601%,RSD均小于1.01%；分离度、稳定性良好。长蒴母草中齐墩果酸的含量达0.2%以上,绿原酸的含量达0.5%以上；不同产地的旱田草中齐墩果酸含量差异较大。结论：七种母草属药材中均含有药用物质Beta-sitosterol和齐墩果酸,这与母草属药材清热解毒、活血祛瘀的传统功效相符。此外,母草、狭叶母草、长蒴母草含有绿原酸,而泥花草与类似品旱田草不含绿原酸。这与经典形态分类结果基本一致,说明同属药用植物种间的亲缘关系与药用物质基础具有一定的相关性,以形态特征为主要依据的民间分类应用也具有一定的合理性。从形态特征、微形态特征及细胞解剖学特征聚类结果综合分析,可考虑将宽叶母草并入母草组。泥花草和旱田草在形态上相似,而微形态特征、细胞解剖学特征差异较大,分析认为泥花草和旱田草可能正向两个不同的方向演化。基于psb-A序列的NJ树支持了经典分类方法中雄蕊是主要分类依据的观点。四川母草属植物的野生资源十分丰富,长蒴母草中齐墩果酸和绿原酸的含量均较高,可作为清热利尿的资源植物进行进一步的研究。同时,不同产地的旱田草中齐墩果酸含量差异较大,其温度湿度、光照可能是影响药用组分积累的关键因素。