表观遗传修饰增加两株浒苔真菌的化学多样性研究

来源 :中国海洋大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:JWPMP
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表观遗传修饰学是研究DNA序列没有发生变化的可遗传的基因表达的改变。近年发现,真核生物的组蛋白乙酰化、DNA去甲基化和染色质去压缩状态可促进基因活化、提高基因转录子的启动。因此这种思路被引用到真核微生物真菌沉默基因的激活和基因表达上。为了激活海洋真菌沉默基因的表达,从其发酵液中发现新的具有生物活性的次生代谢产物,本论文对31株分自青岛海域浒苔样品的真菌进行了筛选,对每株菌株采用DNA甲基化酶抑制剂和组蛋白去乙酰化酶抑制剂进行调节,并对其发酵后得到的萃取物使用TLC/HPLC化学筛选与抗肿瘤生物活性筛选相结合的组合生物学筛选模式进行筛选。最终筛选出代谢产物种类变化丰富生物活性显著提高的2株菌株进行进一步的研究。通过添加DNA甲基化酶抑制剂和组蛋白去乙酰化酶抑制剂筛选出代谢产物种类变化丰富生物活性显著提高的2株菌株进行发酵,并分别在自然条件下发酵该两株菌株,分别萃取获得4份发酵产物。利用常规加压/减压硅胶柱色谱、凝胶柱色谱以及HPLC高效液相色谱法等分离手段分别对发酵萃取物进行化合物的分离纯化及鉴定,共获得41个单体化合物(Fig.0-1)。综合利用红外光谱(IR)、紫外光谱(UV)、质谱(MS)、核磁(NMR)、比旋光(OR)、圆二色谱(CD)等方法确定了化合物的结构。其中从菌株Aspergillusterreus OUCMDZ-2739不添加抑制剂培养条件下分离鉴定化合物7个(1–7),均为已知化合物。从其添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A(TSA)调节的发酵萃取物中分离得到差异化合物18个(8–25),其中新化合物9个,差异类型化合物5类。从菌株Penicillium sp. OUCMDZ-770不添加抑制剂培养条件下分离鉴定化合物8个(26–33),新化合物2个。从其添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂丙戊酸钠(VPA)调节的发酵萃取物中分离得到差异化合物8个(34–41),其中新化合物1个,差异类型化合物4类。对从Aspergillus terreus OUCMDZ-2739中所分离鉴定的化合物进行了常见致病菌的抑菌活性测试和对多种肿瘤细胞的细胞毒活性测试。结果表明:化合物8、12、21对大肠杆菌有弱的抑制活性,MIC分别为25μg/mL、50μg/mL、50μg/mL。对从Penicillium sp. OUCMDZ-770中所分离鉴定的化合物进行了常见致病菌的抑菌活性测试和对多种肿瘤细胞的细胞毒活性测试。结果表明:化合物30、32、41对A549细胞有弱的抑制活性,IC50分别为18μM、21μM、28μM。化合物36、41对Enterobacter aerogenes(产气杆菌)表现出弱的抑制活性,MIC分别为50、30μg/mL。海洋真菌微生物在常规实验室培养条件下由高压、高盐、低温、寡营养这些其独特的生存环境导致其截然不同于陆生微生物的代谢途径常处于抑制状态而不能表达。本论文通过实验证明利用组蛋白去乙酰化酶抑制剂VPA、TSA调节,可有效激活海洋真菌实验室培养条件下沉默基因的表达,进而表现出其独特的代谢途径,产生结构新颖种类不同于常规培养条件下的代谢产物。本文研究内容主要包括以下3个方面:1.目标菌株的筛选。对采自于青岛海域的浒苔样品中分离纯化获得的31株浒苔共附生真菌进行表观遗传修饰的调控,针对每株真菌分别使用DNA甲基化酶抑制剂和组蛋白去乙酰化酶抑制剂进行调控,对每份发酵萃取物采用TLC薄层色谱和HPLC指纹图谱作为化学检测手段,并以抑菌试验、MCF-7肿瘤细胞增殖抑制等手段作为生物活性筛选模型,以化学和生物活性评价相结合的集成筛选模式,筛选代谢产物种类多样性变化丰富、生物活性显著提高的菌株作为目标菌株,最终通过集成筛选获得2株菌株作为研究目标。2.表观遗传修饰调控对两株浒苔来源真菌次生代谢产物影响的研究。对次生代谢产物变化丰富生物活性显著提高的2株浒苔来源真菌分别进行不添加抑制剂培养条件和添加抑制剂进行调节的发酵条件进行规模发酵,分别对4份发酵萃取物进行分离鉴定,通过对比得到表观遗传修饰策略高效性的结论。通过TLC薄层色谱、正相/反相/加压/减压硅胶柱色谱、Sephadex LH-20凝胶柱色谱、HPLC反相高效液相色谱等实验室常规分离方法,从不添加抑制剂培养条件和添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂的培养条件下的发酵萃取物中共分离得到41个单体化合物;应用紫外光谱UV,红外光谱IR,核磁共振波谱NMR,质谱MS等波谱解析技术鉴定了41个单体化合物的化学结构(Fig.0-1),其中新化合物12个。从菌株Aspergillus terreus OUCMDZ-2739不添加抑制剂培养条件下分离鉴定化合物7个(1–7),均为已知化合物,包含五个二苯基-γ-丁内酯类化合物(1–5)、一个氨基酸途径来源化合物(6)和一个聚酮途径来源化合物(7)。从其添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A(TSA)调节的发酵萃取物中分离得到差异化合物18个(8–25),其中新化合物9个,差异类型化合物5类。包括四个新生物合成途径来源化合物(8–11)、一个环外双键γ-丁内酯类化合物(13)、四个呋喃二酮类化合物及其衍生物(15–18)、两个苯并内酯类化合物(21、22)、两个萜类化合物(23、24)和两个其他类化合物(12、14)。从菌株Penicillium sp. OUCMDZ-770不添加抑制剂培养条件下分离鉴定化合物8个(26–33),新化合物2个(26、27)。该菌在不添加抑制剂培养条件下得到了7个二酮哌嗪类环二肽(26、28–33)。从其添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂丙戊酸钠(VPA)调节的发酵萃取物中分离得到差异化合物8个(34–41),其中新化合物1个,差异类型化合物3类。包括3个二酮哌嗪衍生物(34、35、40)、2个α, β不饱和内酰胺类化合物(36、37)、一个二萜类化合物(38)、一个聚酮途径来源化合物(39)、一个苯并噻唑(41)。运用体外生物活性筛选模型,初步评价了单体化合物的肿瘤细胞增殖抑制活性和抑菌活性。其中化合物8、12、21对大肠杆菌有弱的抑制活性,MIC分别为25μg/mL、50μg/mL、50μg/mL。化合物30、32、41对A549细胞有弱的抑制活性,IC50分别为18μM、21μM、28μM。化合物36、41对Enterobacter aerogenes(产气杆菌)表现出弱的抑制活性,MIC分别为50、30μg/mL。3.初步探讨了表观遗传修饰策略对激活海洋来源真菌沉默基因、促进特殊代谢途径的表达进而对次生代谢产物化学多样性的影响。通过对比TLC、HPLC指纹图谱初步阐明了组蛋白去乙酰化酶抑制剂VPA和TSA分别对菌株Aspergillus terreus OUCMDZ-2739、Penicillium sp. OUCMDZ-770次生代谢产物的影响;通过生物活性测试找到了添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA和VPA后导致发酵萃取物生物活性提高的化合物所在。综上所述,通过对两株浒苔来源真菌分别添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA和VPA后对其次生代谢产物影响的系统研究,证明表观遗传修饰策略可有效激活真菌中沉默基因的表达,提高菌株次生代谢产物的化学多样性,同时产生新的活性代谢产物,进而为筛选活性先导化合物提供有效的试验方法和化合物来源。上述研究为充分利用来之不易的海洋微生物资源,最大限度的开发利使用其沉默基因表达,通过独特的代谢途径以此来获得活性新化合物,为先导化合物的筛选和临床药学的研究提供了化合物资源和有益的参考。
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