历史时期博斯腾湖流域的气候和生态环境经历了巨大的变化,如水系的变化和湖泊的展缩,绿洲、故城(镇)的消亡与废弃等,这些变化最终都归结于气候与环境的自然演化,叠加上人类不断对大自然的索取而共同作用的结果。关于环境演变的研究,主要是通过对博斯腾湖湖相沉积物所反映的古气候和环境信息载体的代用指标进行气候重建。而博斯腾湖流域历史时期的人类文明进程主要是将历史文献法与考古学资料相结合,以故城(镇)、交通线路和河流为主线,通过查阅大量的相关文献信息来分析总结。(1)近2.5ka来,博斯腾湖流域所在的整个南疆地区的气候环境演变模式上的变化主要以相对冷湿和相对暖干的交替为主,并将其大致划分为四大相对气候期:500BC~100AD,相对冷湿期,水份条件较好,有利于农作物生长;100~650AD,相对暖干期,气候环境条件较差;650~1000AD,相对冷湿期,温度降低,降水较多;1000AD至今,相对暖干期,出现异常干旱气候,以干旱化为主,期间有几次冷暖波动出现。(2)通过对2.5ka来博斯腾湖流域现存古文化遗址(古城(镇)、古河道及古交通线路)的分布、历史时期屯垦活动及政治经济活动的变迁史三大方面的简单概括,对该地区的人类文明活动的变迁过程及原因进行了总结分析,得出,人类历史时期的活动范围在空间和时间尺度上均呈现出一定的规律性,以屯垦活动为代表的农业文明活动也是时兴时衰,历史时期该区域内的各邦国(主古焉耆国)的政治活动的变迁与中原各政权的兴衰具有一定的关联性,即,在中原政权相对稳定繁荣时期,焉耆地区受中原地区的管辖,政局稳定,经济往来密切;在中原政权相对跌宕没落时期,焉耆地区主要受西域强权的控制,政局不稳定,经济、生产生活都受到了严重的影响。(3)历史时期博斯腾湖流域气候环境的干湿变化与古人类文明之间存在着某种内在的关系。一方面,由于气候的变化,造成水热条件的不同,引起农、牧业经济的相应变化,使人类生存环境、条件变化,进而影响到政局的稳定和人口的变化。另一方面,由于人类活动的变化,反过来又可能会影响到环境的演变。与人类活动的活跃、能动性相比,自然环境是缓慢变化的,人类活动有时甚至是决定着自然环境变化过程、特点及类型。人类活动对自然环境的干预度加强,如博斯腾湖流域历史时期的战争与宗教活动、不合理的引水灌溉、引起的河流下游地区盐碱化等,均会引起该地区自然环境的变化日趋迅速。博斯腾湖流域的演变历史是以新疆为代表的亚欧大陆干旱区演变历史的缩影。