甘蔗细菌性茎软腐病菌的分离鉴定及生物学特性和比较基因组学分析

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甘蔗是中国最重要的糖料作物。2019年以来,广西北海市和崇左市出现了一种甘蔗新病害——细菌性茎软腐病。症状表现为叶片枯黄萎蔫,幼嫩蔗茎组织软腐并流出菌脓,病部散发酸臭味,罹病植株在数日内死亡。为了明确致病菌,本研究采集病株进行了病原菌的分离与鉴定,并开展了病原菌的生物学特性、主要致病因子及全基因组测序等相关研究。主要研究结果如下:(1)15个符合科赫氏法则的细菌分离物被确定为甘蔗细菌性茎软腐病的致病菌。综合形态学观察、生化特性、16S r RNA序列比较以及3个管家基因(dna X、gyr B、rec A)序列的系统发育分析结果,将引起甘蔗细菌性茎软腐病的病原菌鉴定为玉米迪基氏菌北海分离物BH9(Dickeya zeae BH9)。(2)甘蔗病原菌D.zeae BH9的寄主范围广泛,其基本生物学特性与引起水稻基腐病的D.zeae EC1菌株和引起香蕉软腐病的D.zeae MS1菌株类似。甘蔗菌株D.zeae BH9的胞外多糖和纤维素酶产量明显低于水稻菌株D.zeae EC1和香蕉菌株D.zeae MS1,三者的果胶酶产量相近。但相比于D.zeae EC1和D.zeae MS1,D.zeae BH9具有更强的运动性、聚集性和高产靛蓝色素的特性。另外,值得一提的是,D.zeae BH9虽然不产生zeamines毒素,但是在很低的细菌浓度下就能明显抑制水稻种子萌发。(3)D.zeae BH9的基因组大小为4927334 bp,含有4489个预测蛋白编码基因,在已测序的同种D.zeae菌株中基因组最大。基于全基因组序列的系统发育分析显示,D.zeae BH9与水稻菌株D.zeae EC1和D.zeae EC2的亲缘关系最近。比较基因组分析表明,D.zeae BH9与D.zeae CE1的基因组共线性最好。此外,在已测序的6个同种D.zeae菌株中,D.zeae BH9含有5个特有的基因家族。本研究揭示了甘蔗细菌性茎软腐病菌D.zeae BH9的生物学特性、致病因子和基因组信息,这些结果有助于阐明甘蔗细菌性茎软腐病的发生原因,为深入研究该病原菌的致病机理和病害防治奠定基础。
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