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本研究利用2014和2015年在黑龙江省30个市(县)采集的稻瘟病菌穗颈瘟标样,获得稻瘟病菌的单孢菌株,对其进行对主栽品种的致病能力、无毒基因在各地区的分布情况和群体结构的研究,明确了黑龙江省稻瘟病菌群体的多样性和变异的复杂性,为黑龙江省水稻种植的合理布局、抗病种质资源的筛选和培育提供理论依据。(1)以苗期接种病原菌的方法,以致病率、毒力频率和联合致病系数为指标分析171个稻瘟病菌对18个水稻主栽品种的致病性。结果表明:不同的稻瘟病菌对供试主栽品种的致病能力有明显差异,致病率范围从0~78%;供试菌株对各供试品种的毒力率明显不同,龙粳31的毒力频率最低,为1.17%;以联合致病性为指标探究不同品种组合与稻瘟病菌间的互作,龙洋16+龙粳31、龙粳31+龙粳43、龙粳31+松粳20为高抗的搭配组合,其RAC大于0.8,VAC为0,可以在生产推广中搭配使用。(2)采用设计特异性引物的方法对288个稻瘟病菌菌株进行PCR扩增,检测稻瘟病菌无毒基因AVRPiz-t和AVR-Pita的存在情况并对部分菌株进行测序分析。结果表明:无毒基因AVRPiz-t和AVR-Pita在黑龙江省的出现频率分别为56.6%和22.9%。2014年和2015年无毒基因AVRPiz-t的出现频率分别为37.0%和95.8%,AVR-Pita的基因频率分别为23.0%和22.9%。供试菌株的无毒基因在年份、地区、基因之间都存在明显差异。对部分菌株的测序分析发现两个无毒基因在黑龙江省稻瘟病菌群体中都存在变异的情况,特别是AVR-Pita存在多个变异位点和类型,这些改变可能会导致基因功能缺失,失去无毒性。表明黑龙江省稻瘟病菌株变异的易变性和遗传多样性。(3)采用Pot2-rep-PCR指纹识别方法对227个菌株进行扩增,研究黑龙江省菌株的遗传多样性。结果表明:供试菌株分别扩增到2~13条DNA条带,大小在500~6000 bp之间。经UPGMA聚类分析,2014年的162个菌株在0.73的遗传距离下被划分为10个遗传谱系。2015年65个菌株在0.77的遗传距离下被划分为8个遗传谱系。2014和2015年共227个稻瘟病菌菌株在0.75的相似水平下被划分为12个遗传宗谱。黑龙江省稻瘟病菌在地区和年份之间遗传谱系都有很大的变化,说明了黑龙江省稻瘟病菌的高度变异和丰富的遗传多样性。