大气本质上是一个混沌系统，由于各种不确定性的存在，必须用集合预报的方法代替传统的单个控制预报方法。上个世纪九十年代中期以后，集合预报技术逐渐被应用到中尺度短期天气预报，特别是热带地区常见的天气现象之一热带气旋的预报。 在建立集合预报系统的时候需要考虑各种不确定性的影响，不确定性主要有三种：与初始条件相关的不确定性，与模式相关的不确定性以及对于区域模式所涉及到的侧边界条件的不确定性。本文综合考虑了这三种不确定性的影响，建立了一个拥有16个成员的集合预报系统来模拟2003年第13号热带气旋“杜鹃”，利用不同气象中心提供的初估值来代表不同的初始条件和边界条件的不确定性，用不同的边界层参数化方案来代替模式的不确定性。通过考察模拟结果对各种不确定性的敏感性，发现初始条件的不确定性对模拟结果的影响主要发生在模式积分时间的前18h，模式的不确定性在整个积分过程中始终存在，而边界条件不确定性在12h以后才有明显的作用。因此对0-12h的预报只需要考虑初值和模式的不确定性；对12-18h的预报，需要考虑初值，边界条件和模式的不确定性；对18-48h的预报则只要考虑边界条件和模式的不确定性。 不同的不确定性对模拟结果产生作用的预报时间段不同，可以为我们优化中尺度短期天气特别是热带气旋的集合预报系统提供理论依据。