土生空团菌(Cenococcum geophilum Fr.)是一种重要的外生菌根真菌,它在全球范围内分布,并且有着广泛的寄主。土生空团菌最突出的特点是具有很强的抗旱性,因此可望成为内蒙古及西部地区最有潜在应用价值的菌根真菌之一。土生空团菌由于没有有性阶段仅仅形成不育的菌丝体和菌核,传统的研究方法很难满足对该菌分类鉴定及遗传多样性的研究。为了摸清土生空团菌的遗传变异情况,本研究以分离自虎榛子、山杨、白桦、云杉、油松、蒙古栎等六种不同寄主植物的27个土生空团菌纯培养菌株及来自法国的5个土生空团菌菌株共32个菌株作为实验材料,在形态特征初步鉴定的基础上,利用PCR-RFLP标记对其进行深入鉴定并结合RAPD标记对鉴定后的菌株进行聚类分析,研究供试菌株的遗传变异程度,对其遗传多样性进行综合评价。研究结果表明:1.形态特征及分子标记结果综合判定SO4、O4、O5、SO5、SO1、SPOP1、SPOP2、SPOP3、SPOP6、SPOPX、SPICEA、SB1、SB2、SB5、CG、CG54、CG5#、CG417、PICEA、CGAM51等20个菌株为土生空团菌;O1、O2、SO2、POP2、POP7、SPOP4、SPOP5、B2、B3、B5、PINUS1、QUERCUS1等12个菌株等不是土生空团菌。2. RFLP–PCR和RAPD标记,二者均向我们揭示了源于不同地域、不同寄主及来源于同一寄主不同分离株的20个供试菌株是一个复杂的群体,有着较丰富的遗传多样性,且在本研究中RAPD比RFLP-PCR更能揭示土生空团菌的遗传变异,即能更加真实地反映出土生空团菌丰富的遗传多样性。