赤霉素处理下甜樱桃果实转录组分析及成熟软化相关基因表达分析

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果实的成熟软化是一个复杂的过程,细胞壁组分的降解和结构的改变影响着果实硬度和质地变化,是导致果实耐贮性降低的主要原因。本试验以10生的‘红灯’甜樱桃为试材,以不同浓度GA3进行处理。利用高通量测序技术对GA3处理下的甜樱桃果实进行转录组测序,通过生物信息学分析,选取测序结果中的细胞壁降解酶基因及调控基因MADS-box转录因子,通过实时荧光定量PCR分析这些基因在GA3处理下基因表达水平。研究结果如下:(1)本试验共获得88593条转录本,平均长度1088bp,预测到65727条unigenes,平均长度1368bp。将unigenes在Nr,Nt,Pfam,KOG/COG,Swiss-prot,KEGG,GO 7大数据库中进行比对注释,共有45115条unigenes得到注释。对不同GA3处理浓度和不同时期的差异基因进行分析,筛选出PG、PME、α-L-Af、Cx、β-Gal、XTH、PEL 7个细胞壁降解相关酶基因,其中PG,β-Gal基因上调表达,PME、α-L-Af、Cx、XTH、PEL基因下调表达。(2)PG、PME、α-L-Af 3个基因的表达水平随着甜樱桃果实成熟而不断上升,与硬度变化的相关性较高,与果实成熟软化密切相关。Cx和β-Gal基因也参与果实成熟软化;而XTH和PEL基因在果实硬核期表达水平较高,与果实成熟软化启动相关。(3)高浓度GA3处理提高PG基因表达水平,提前PME基因表达峰值,进而使PG、PME酶活性升高,促进果实细胞壁的降解,同时促进α-L-Af、Cx、β-Gal、PEL和XTH等基因的表达,加速果实成熟软化。(4)MADS-box2、MADS-box3、MADS-box4、MADS-box6和MADS-box7主要在甜樱桃果实硬核期和第II迅速生长前期调节果实的成熟,MADS-box1、MADS-box5和MADS-box8在甜樱桃转色后调控果实成熟。GA3处理提高MADS-box1、MADS-box2、MADS-box3、MADS-box4、MADS-box5、MADS-box8基因表达水平,推迟MADS-box1、MADS-box2、MADS-box3、MADS-box4、MADS-box6、MADS-box8基因表达峰值,抑制MADS-box7基因表达,GA3处理通过影响MADS-box转录因子的表达来影响甜樱桃果实成熟。
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