银屑病合并代谢综合征患者肠道菌群的研究

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目的:寻找银屑病合并代谢综合征病人肠道菌群的差异、深度剖析肠道微生物群特征、筛选标志性的肠道微生物,同时探究差异性的代谢通路。方法:选取银屑病合并代谢综合征、银屑病、代谢综合征病人及健康组的粪便标本各10例,进行16S r RNA基因组测序,构建Miseq文库及通过IIIumina平台测序,以获得样本在微生物各分类学水平上的物种注释信息;计算微生物多样性及物种结构组成分析,筛选具有疾病鉴别能力的菌属及与疾病相关的代谢通路;相关研究结果采用R脚本作图展示。结果:1.PSO+MS组肠道菌群与N组有一定重合度,Venn图提示4组间共有的OTU数目为832个,其中PSO+MS组所独有的OTU种类数目816个。PSO+MS组样本的拟杆菌门所占比例较高。PSO+MS组厚壁菌门/拟杆菌门比值增大(P<0.05)。2.PSO+MS组比N组Chao指数(1299±514比2758±157,Tukey法,P<0.05),Simpson指数(0.92±0.58比0.95±0.59,Tukey法,P<0.05)均明显低于N组。PSO+MS组比PSO组菌群多样性未见明显差异。使用PCA分析方法分析四组样本中的β生物多样性,PSO+MS组与N组在第一主要成分中(30.7%)可显著区分,各组样本各自聚集。3.物种差异性分析LEf Se分析结果选取LDA score>3的物种具有统计学差异的biomarker大约有13种。PSO+MS组中显著增多的产芽胞菌纲(Erysipelotrichi,P=0.0138)、丹毒丝菌目(Erysipelotrichales,P=0.0137)、丹毒丝菌科(Erysipelotrichacea,P=0.0137)、芽殖菌属(Gemmiger,P=0.0003)、梭菌属(Clostridium,P=0.017)、阿克曼氏菌属(Aeromonadales,P=0.0238)。在PSO组中,变形菌门(Proteobacteria)、γ变形杆菌纲(Gammaproteobacteria,P=0.0043)显著增加的。在N组中,消化球菌科(Peptococcaceae,P=0.029)、S24-7科(P=0.018)、消化球菌属(peptococcus,P=0.027)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium,P=0.0317)、柯林斯菌属(Collinsella,P=0.0041)显著增加。4.在代谢通路方面,集中在代谢途径和生物合成途径。初步探索了预测银屑病合并代谢综合征组与银屑病组差异性代谢通路的为核糖-磷酸盐的降解、真核微生物糖原降解。结论:银屑病合并代谢综合征患者存在肠道菌群失调,菌群多样性、丰富度低于健康人群,与银屑病患者未见明显差异。本研究差异性菌属在银屑病合并代谢综合征组中芽殖菌属(Gemmiger,P=0.0003)、梭菌属(Clostridium,P=0.017)、(Aeromonadales,P=0.0238)显著增加的。在健康对照组中消化球菌属(peptococcus,P=0.027)、柯林斯菌属(Collinsella,P=0.0041)显著增加,而仅在银屑病合并代谢综合征中个别样本中少量表达。
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